资源预览内容
第1页 / 共41页
第2页 / 共41页
第3页 / 共41页
第4页 / 共41页
第5页 / 共41页
第6页 / 共41页
第7页 / 共41页
第8页 / 共41页
第9页 / 共41页
第10页 / 共41页
亲,该文档总共41页,到这儿已超出免费预览范围,如果喜欢就下载吧!
资源描述
Western blot原理与 相关技术操作 主要内容 Western blotWestern blot一般流程一般流程 Western blotWestern blot常见问题分析常见问题分析 Western blotWestern blot简介简介 Western blot基本原理 在电场的作用下将电泳分离的多肽从凝胶转移至一种固相 支持体,然后用这种多肽的特异抗体来检测。 Western blot的中文名称是:蛋白质印迹,也叫免疫印 迹(immunoblotting)。是分子生物学中常用的三种印 迹技术之一。目前公认的该实验技术的发明人为美国 斯坦福大学的乔治斯塔克(George Stark)。 Western blot蛋白质印迹 Southern blotDNA印迹 Northern blotRNA印迹 Western blot 优点 高分辨率的电泳技术 特异敏感的抗原-抗体反应 1-5ng中等大小的靶蛋白 Western blot应用 目的蛋白的表达特性分析 目的蛋白与其它蛋白的互作 目的蛋白的组织定位 目的蛋白的表达量分析 主要内容 Western blotWestern blot简介简介 Western blotWestern blot一般流程一般流程 Western blotWestern blot常见问题分析常见问题分析 6.最后加上相应的 底物溶液,当二抗 上的酶催化底物产 生化学发光时,用X 光片曝光,洗片后 就会产生可见的区 带,指示目的蛋白 质的位置和强弱。 3.通过SDS-PAGE电 泳将蛋白样品分开。 5.印迹首先用封闭液(如5 的脱脂奶粉)处理以封 闭固相载体上剩余的疏水 结合位点,而后用目的蛋 白的抗血清(一抗)孵育 ,印迹中只有目的蛋白质 与一抗特异性结合。洗去 游离的一抗后,用再与酶 标记的二抗孵育 4.将电泳分离的蛋 白从凝胶转移至一 种固相支持体.转移 后的硝酸纤维素膜 就称为一个印迹( blot),用于对蛋 白质的进一步检测 。 1.样品前处 理,提取细 胞或组织蛋 白 2.测定蛋白浓度,样 品变性 Western blot Western blot 流程流程 一、蛋白样品的提取 提取细胞蛋白多是利用将细胞裂解、破碎、使蛋白质释放的原理。 提取蛋白质的方法很多, 鉴于后续实验对蛋白性质的要求不同, 因此裂解方法有所不同。 不论采用那种方法,都应遵循以下原则: 1尽可能采用简单方法进行样品处理,以避免蛋白丢失。 2细胞和组织样品的制备应尽可能减少蛋白的降解,低温和蛋 白酶抑制剂可以减少蛋白的降解,蛋白酶抑制剂的种类很多,要根 据具体情况具体选择。 3样品裂解液应该新鲜制备,并且分装冻存于-80。切勿反复 冻融已制备好的样品。 目的:要获得高丰度、高品质的蛋白质,以满足后续实验的需求 RIPA裂解液(中度)配方: 1 M Tris-HCl(pH7.4)2 ml 3 M NaCl(MW:58.5)2 ml NP400.4 ml 0.5 M EDTA 0.04 ml 5%脱氧胆酸钠4 ml 18兆去离子水调整总体积40ml 50mM Tris-HCl(pH7.4) 150mM NaCl 1% NP40 0.5%脱氧胆酸钠(sodium deoxycholate) 0.5 mM EDTA 每10ml RIPA裂解液放入0.1ml蛋白酶抑制剂cocktail. -20分装保存,临用前无需加入PMSF。 二、蛋白样品的定量 n Western blot作为一项半定量实验技术,电泳前,必须 尽量使各组之间总蛋白量基本一致; n 蛋白质总量不足可能妨碍对目的蛋白的鉴定; 蛋白质含 量太高则会使带形扭曲,甚至会影响此电泳方法的分辨力 。 n目前常用比色法测定样品蛋白的含量:Bradford法(考 马斯亮蓝法)、Lowry法(Folin-酚试剂法)、BCA法等。 BCA法蛋白浓度测定 原理:二价铜离子在碱性的条件下,可以被蛋白质还原成一价铜离子(biuret reaction),一价铜 离子和独特的BCA Solution A(含有BCA)相互作用产生敏感的颜色反应。两分子的BCA螯合一个铜离 子,形成紫色的反应复合物。该水溶性的复合物在562nm处显示强烈的吸光性,吸光度和蛋白浓度在 广泛范围内有良好的线性关系,根据吸光值可以推算出蛋白浓度。 试剂:BCA工作液 ,双蒸水,蛋白标准液( 将2mg/ml蛋白溶液稀释至2mg/ml,1mg/ml,0.5mg/ml, 0.25mg/ml, 0.125mg/ml, 0.0625mg/ml。) 管号012345 蛋白标准液10050 2512.56. 253.125 ddH2O0507587.593.596.8 样品1010 10101010 BCA(ML)222222 三、蛋白样品的变性 2SDS-PAGE上样缓冲液: DTT可临用前以1:4比例混合加入,亦可全部配好分装,-20冻存。 按1:1比例与蛋白质样品混合,95100加热515min,冰上冷却后再 上样,上样量一般为20-25l,总蛋白量2050g。 1M Tris-HCl(pH6.8)10 ml 1M DTT20 ml SDS4 g 甘油20 ml 溴酚蓝0.2 g 总体积100ml 100mM Tris-HCl(pH6.8) 200mM DTT 4%SDS 0.2%溴酚兰 20%甘油 ddH2O SDS: 阴离子去污剂 变性剂 氨基酸侧链与SDS充分结合形成带负电荷的蛋白质-SDS胶束。 蛋白质-SDS胶束所带的负电荷大大超过了蛋白质分子原有的电荷 量,消除了不 同分子之间原有的电荷差异。 与强还原剂一起使蛋白分子氢键、疏水键打开,使蛋白质分子线 性化。 蛋白质-SDS胶束的特点: (1)具有相同的形状,形 状像一个长椭圆棒 (2)平均1g 蛋白质结合 1.4g SDS (3)短轴对不同的蛋白质 亚基-SDS胶束基本上是相 同的 (4)长轴的长度则与亚基 分子量的大小成正比 不连续的电泳缓冲体系。 SDS蛋白质复合物在凝胶电泳时,不再受蛋白质电荷 与形状的影响,而只取决于蛋白质分子量的大小。 四、SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳 SDS聚丙烯酰胺凝胶配制及蛋白分离范围 5ml10%分离胶3ml5%浓缩胶 ddH2O 1.9 2.1 30%Acr 1.7 0.5 PH8.8Tris 1.3 PH6.8Tris 0.38 20%SDS 0.025 0.015 10%AP 0.05 0.03 TEMED 0.002 0.003 作用缓冲液PH凝胶浓度 浓缩胶 使蛋白样品浓缩pH6.8Tris-Cl低,2-5% 分离胶 使蛋白样品分离pH8.8Tris-Cl高,根据蛋白大小 凝胶浓度()线性分离范围(KD) 1512-43 1016-68 7.536-94 5.057-212 灌胶 灌制分离胶 隔绝空气 灌制浓缩胶 插入梳子 电泳 加足够的电泳液后开始准备上样。(电泳液至少要漫过内测的小玻璃板。 )用微量进样器贴壁吸取样品(Marker: 5-10l ;样本:10 l )。将加 样器针头插至加样孔中缓慢加入样品。(加样太快可使样品冲出加样孔,若有 气泡也可能使样品溢出。加入下一个样品时,进样器需在外槽电泳缓冲液中洗 涤3次,以免交叉污染。 采用恒压的方法:1.恒压60V,至样本跑过 浓缩胶;2.将电压调至120V至 溴酚兰刚跑出即可终止电泳,准备进行进行转膜。 Staking gel Separating gel 五、转膜 凝胶电泳结束后,将凝胶上分离的蛋白条带通过转移电泳方式转印至 固相支持物上,常用的固相支持物有NC (硝酸纤维素)膜、尼龙膜 及PVDF(聚偏氟乙烯)膜。 选择膜的主要根据有: 1.膜与目的蛋白分子的结合能力(也就是单位面积的膜能结合蛋白的载 量) 2.膜的孔径(也就是拦截蛋白的大小) 3.不影响后续的显色检测(也就是适合用于所选显色方法,信噪比好) 4.如果后继实验有其他要求,比如要做蛋白测序或者质谱分析,还要根 据不同目的来挑选不同的转移膜 转移膜的选择转移膜的选择 湿转系统 转一张膜需准备滤纸和1张转印膜。切滤纸和膜时一定要戴手套,因 为手上的蛋白会污染膜。转膜前,转印膜以及滤纸均需浸润在电转液 中活化15-20min(其中PVDF膜需在无水甲醇中活化30min后再浸润于 电转液中,且滤纸应与胶和膜的大小一致)。 将玻板轻轻撬开,将凝胶剪裁后从玻板上移至电转液中。从阴极到正 极,按照三层滤纸 凝胶 转印膜 三层滤纸的顺序制成“三明 治”(湿转在三明治的两侧各加一层活化过的海绵,同时应注意去除 膜、凝胶和滤纸之间的气泡)。 - 滤纸 凝胶 膜 滤纸 + 半干转移系统 转完后将膜用1丽春红染液染5min(于脱色摇床上摇)。然后用水冲洗掉 没染上的染液就可看到膜上的蛋白,将膜晾干备用。 将凝胶用考马斯亮蓝染色,观察凝胶中的蛋白是否完全转至印迹膜上。 六、转膜后检测六、转膜后检测 Substrate Protein Protein Blocking AgentBlocking AgentBlocking Agent Membrane Primary Antibody Secondary Antibody/Enzyme (E) E E E E s s s s s s s s s Product P P P P P 七、封闭,结合一抗,结合二抗 封闭封闭 为避免作为检测试剂的特异性第一抗体与膜发生 非特异性结合,使非特异性背景提高,需对膜上 的潜在结合位点进行封闭处理。 5%脱脂奶粉或BSA(室温孵育1h) Tween-20的作用:减少非特异性吸附,不影响抗 体与抗原的结合。 结合一抗、二抗 把膜放在密闭塑料袋或者培养皿中,根据膜面积以 0.1mL/cm2的量加入一抗溶液,摇床上平缓摇动,于室 温孵育1-2小时或4过夜。 回收一抗溶液,用TBST漂洗膜3次,每次10min。 加入二抗,摇床上缓慢摇动,于室温孵育1-2小时或4 过夜。 用TBST漂洗膜3次,每次10min。 最后用TBS漂洗膜2次,每次10min。 八、固相免疫检测 利用ECL(增强化学发光)发光检测目的蛋白。 ECL试剂采用氧化还原反应的原理: 发光液A和B分别是鲁米诺和过氧化氢,在辣根过氧化物酶(HRP) 的催化作用下,鲁米诺与过氧化氢反应生成一种过氧化物,过氧化物不 稳定随即分解,形成一种能发光的电子激发中间体,当后者由激发态返 回至基态,就会产生荧光。 九、Western blot结果分析 目的蛋白的灰度值除以内参的灰度值以校正误差,所 得结果代表某样品的目的蛋白相对含量。 内参的选择 内参即是内部参照,对于哺乳动物细胞表达来说一般是指由管家基因编码 表达的蛋白,它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,一般要选择一个在处理 因素作用的条件下蛋白含量不会发生改变的蛋白作内参。 内参起着校正总蛋白上样量的重要作用,只有在内参条带基本均匀一致的 情况下,目的蛋白条带出现的差异才有意义,表明的确是实验设计的干预因素 造成目的蛋白量的变化,而不是加样误差造成目的条带含量的变化。 内参名称分子量大小适用范围 Tubulin55kD胞浆和全细胞 VCDA1/Porin31kD线粒体 COXIV16kD线粒体 Lamin B166kD细胞核 TBP38kD细胞核 -actin 42kD胞浆 GAPDH 35kD胞浆 主要内容 Western blotWestern blot简介简介 Western blotWestern blot一般流程一般流程 Western blotWestern blot常见问题分析常见问题分析 SDS-PAG
收藏 下载该资源
网站客服QQ:2055934822
金锄头文库版权所有
经营许可证:蜀ICP备13022795号 | 川公网安备 51140202000112号