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2003年4月14日宣布人类基因组序列图完成 这标志着进入了后基因组时代。 人类基因组:指DNA分子所携带的全部 遗传信息。 蛋白质组:生物个体表达的蛋白质分子的 总和。主要是对蛋白质功能的研究 思考1 分离生物大分子的基本思路是什么? 选用一定的物理或化学的方法分离具有 不同物理或化学性质的生物大分子。 思考2 蛋白质的分离和提取的原理是什么? 根据蛋白质各种特性的差异,如分子的 形状和大小、所带电荷的性质和多少、 溶解度和吸附的性质和对其他分子的亲 和力等等,可以用来分离不同蛋白质。 思考3 高温灭菌和酒精灭菌分别利用蛋白质 的何种作用,作用结果是什么被破坏? 变性、变性、空间结构 思考4 人们用鸡的红细胞提取DNA,用人 的红细胞提取血红蛋白的原因是什么? 鸡的红细胞具有细胞核,含有DNA, 便于进行DNA的提取,人的红细胞无 细胞核,结构简单,血红蛋白含量丰 富便于提取血红蛋白。 一、基础知识: 凝胶色谱法(分配色谱法): 1、凝胶: 一些微小多孔的球体(内含许多贯穿的 通道,由多糖类构成如葡聚糖、琼脂糖 ,具多孔的凝胶就叫分子筛) 2、概念:根据被分离物质的蛋白质相对 分子质量的大小,利用具有网状结构的凝 胶的分子筛作用,来进行分离。 3、原理:当不同的蛋白质通过凝胶时,相 对( )的蛋白质容易进入 凝胶内部的通道,路程( ),移动速 度( ),而( ) 的蛋白质无法进入凝胶内部的通道,只能 在( )移动,路程( ), 移动速度( ),相对分子质量不同 的蛋白质因此得以分离。 4、具体过程 相对分子质量较小 较长 较慢 相对分子质量较大 凝胶外部 较短 较快 1、概念:在一定的范围内,能对抗外 来少量强酸、强碱或稍加稀释不引起溶液 PH发生明显变化的作用叫做缓冲作用,具 有缓冲作用的溶液叫做缓冲溶液。 缓冲溶液: 2、作用: 能够抵制( )的对溶液 的( )的影响,维持PH基本不变 。 外界的酸或碱 PH值 3、缓冲溶液的配制 通常由( )种缓冲剂溶解于水 中配制而成。调节缓冲剂的( ) 就可以制得( )使用的 缓冲液。 12 使用比例 在不同PH范围内 思考:说出人体血液中缓冲对。 NaH2PO4 / Na2HPO4 H2CO3 / NaHCO3 电泳: 1、概念:指带电粒子在电场作用下发生 迁移的过程。 思考:在血红蛋白整个实验室中用的缓冲 液是什么?它的目的是什么? 使用的是磷酸缓冲液,目的是利用缓冲 液模拟细胞内的PH环境,保证血红蛋白 的正常结构和功能,便于观察(红色) 和材料的科学研究(活性) 2、原理:许多重要的生物大分子,如 ( )等都具有( ) 在( )下,这些基团会带上( ) 。在电场的作用下,这些带电分子会向 着与其( ) 移动。电泳利用了待分离样品中各种分子 ( )以及分子本身( )、( )的不同使带电分子产生 不同的( ),从而实现样品中 各种分子的分离。 多肽、核酸 可解离的基团 正电或负电 所带电荷相反的电极 带电性质的差异 大小 形状的 迁移速度 一定的PH 聚丙稀酰胺凝胶:是由单体丙烯酰胺和交 联剂N,N-甲叉双丙烯酰胺在引发剂(过硫 酸铵和催化剂(四甲基已二胺)的作用下 聚合交联成三维网状结构的凝胶 分类: 琼脂糖凝胶电泳和聚丙稀酰胺凝胶电泳。 测定( )通 常用十二烷基硫酸钠(SDS)聚丙稀 酰胺凝胶电泳 蛋白质相对分子质量 为了消除静电荷对迁移率的影响可以在凝胶 中加入( )。SDS能使蛋白质发生完全变性 。由几条肽链组成的蛋白质复合体在SDS的作 用下会解聚成单条肽链,因此测定的结果只 是( )。SDS能与各种蛋白 质形成蛋白质SDS复合物,SDS所带负电荷 的量大大超过了蛋白质分子原有电荷量。因 而掩盖了不同种蛋白质间的电荷差别,使电 泳迁移率完全取决于( )。 蛋白质在聚丙烯酰胺凝胶中的迁移率取决于 它所带静电荷的多少以及分子的大小等因素。 SDS 单条肽链的分子量 分子的大小 聚丙烯酰胺凝胶电泳对分离大分子具有 较高的分辨率,但核酸比蛋白质分子大 得多,只能采用较大孔径的琼脂糖凝胶 电泳。核酸分子本身含有大量的磷酸根 ,核酸带负电荷,在电场中向正极移动 。溴化乙啶荧光染料对核酸染色在紫外 线的照射下,发出橙红色荧光。根据荧 光条带的粗细和分布的位置,可以用在 对PCR扩增效果的鉴定上。 说明: 电泳检测PCR结果 琼脂糖凝胶电泳琼脂糖凝胶电泳 二 实验操作 蛋白质的提取和分离一般分为四步: 1.样品处理 血 液 血浆 水分 固体物质 血浆蛋白 无机盐 磷脂 葡萄糖等 血细胞 白细胞 血小板 红细胞 (最多) 血红 蛋白 ( ) 两个a肽链 两个一肽链 样品处理粗分离纯化纯度鉴定 共四条肽链 90 目的:去除( ) 方法:( )离心(速度越 高和时间越长会使白细胞和淋巴细胞等一 同沉淀达不到分离的效果),然后用胶头 吸管吸出上层透明的( ),将下 层( )的红细胞液体倒入( ) 每个肽链环绕( ),此基 团可携带( )。血 红蛋白因含有( )而呈红色。本课题 可选用猪、牛、羊或其他脊椎动物的血液来分 离血红蛋白。 一个亚铁血红素基团 一分子氧或一分子二氧化碳 血红素 (1)红细胞的洗涤 杂质蛋白 低速短时间 黄色血浆 暗红色烧杯 再加入用( )的( ) 质量分数为0.9的氯化钠溶液洗涤 低速离心(低速短时间) 重复4、5步骤( )次,直至上清 液中已没有( ),表明洗涤干净。 利于后续血红蛋白的分离纯化,不可洗 涤次数过少。 五倍体积生理盐水 三 黄色 (2)血红蛋白的释放 加( )到( )体积, 再加40体积的( )( 溶解细胞膜) ,置于( )上充分搅拌10分钟 (加速细胞破裂), 细胞破裂释放出血红蛋 白. (3)分离血红蛋白溶液:将搅拌好混合液转 移到离心管内,以2000r/min的速度离心10 min ,试管中的溶液分为4层: 原血液 甲苯 磁力搅拌器 蒸馏水 第1层(最上层): ( )甲苯层 第2层(中上层): ( )的沉淀层, ( )色薄层固体 第3层(中下层): ( )的水溶液层 ( )的液体 第4层(最下层): 其它杂质( )的沉淀层 无色透明 脂溶性物质 白 血红蛋白 红色透明 暗红色 用滤纸过滤, 除去脂溶性沉 淀层,于分液 漏斗中静置片 刻后,分出下 层的红色透明 液体。 取( )ml的血红蛋白溶液装入( ) 中,将透析袋放入盛有300ml的物质的量 浓度为20mmol/L的( )中, pH为( ),透析12小时,目的是( )或用于更换样品中的( )。透 析袋一般用硝酸纤维素制成,又称玻璃纸 。 除去样品中分子量较小的杂质 透析袋 磷酸缓冲液 7.0 缓冲液 (4)透析 1 2.凝胶色谱制作 1)凝胶色谱柱的制作 取长40厘米,内径1.6厘米的玻璃 管,两端需用砂纸磨平。 底塞的制作:打孔 挖出凹穴 安装移液管头部 覆盖尼龙网,再用100 目尼龙纱包好。a、选择合适的的橡皮塞, 中间打孔;b、在橡皮塞顶部切出锅底状的 ( ),在0.5ml的( )头部切 下( )长的一段,插入橡皮塞孔内, 上部不得超过橡皮塞的凹穴底面。 凹穴移液管 5cm 底塞中插入的玻璃管的上部不得超出橡皮 塞的凹穴底面,否则难以铺实尼龙网,还 会导致液体残留,蛋白质分离不彻底。 注意 c.剪尼龙网小圆片覆盖在( ) 上,用( )的尼龙纱将橡皮塞( )包好,插到玻璃管一端。 d、色谱柱下端用移液头部做( ) ,连接一细的( ),并用螺旋 夹控制尼龙管的( ),另一端 放入收集( )的收集器内 橡皮塞的凹面 100目 上部 出口部位 尼龙管 打开与关闭 色谱流出液 安装其他附属结构。 顶塞的制作: 插入安装了玻璃管的橡皮塞 组装:将上述三者按相应位置组装成一个 整体。 2)凝胶色谱柱填料的处理 (1)凝胶的选择: ( )(G-75) “G”表示凝胶的交联程度,膨胀程度 及分离范围。 75表示凝胶的得水值,即每克凝胶 膨胀时吸水7.5克。 (2)方法: 配置凝胶悬浮液:计算并称取一定量 的凝胶浸泡于( )中充分溶胀后 ,配成( )。 蒸馏水 凝胶悬浮液 交联葡聚糖凝胶 固定:将色谱柱处置固定在支架上 装填: 将( )一次性的缓慢 倒入( )内,装填时轻轻敲动色 谱柱,使凝胶填装均匀。 (3)凝胶色谱柱的装填方法 凝胶悬浮液 色谱柱 注意:凝胶装填时尽量紧密,以降低凝胶 颗粒之间的空隙。装填凝胶柱时不能有气 泡存在:因为气泡会搅乱洗脱液中蛋白质 的洗脱次序,降低分离效果。 洗涤平衡 装填完毕后,立即用缓冲液洗脱瓶,在( ) 高的操作压下,用300ml的20mmol/l的磷酸缓冲 液(pH为7.0)充分( )12小时。 洗涤平衡 注意液面不要低于凝胶表面,否则可能有 气泡混入,影响液体在柱内的流动与最终 生物大分子物质的分离效果。不能发生洗 脱液流干,露出凝胶颗粒的现象,否则重 新填装。 50cm 3)样品加入与洗脱 加样前 打开下端出口,使柱内凝 胶面上的( )缓 慢下降到与( ) 平齐,关闭出口 缓冲液 凝胶面 加透析样品 调整缓冲液面:与凝胶面平齐 滴加透析样品:用( )将1ml( ) 的样品加到色谱柱的( ) 样品渗入凝胶床:( ) 洗脱:打开下端,用磷酸缓冲液洗脱 收集:待( )接近色谱柱底端 时,用试管收集流出液,每( )收 集一试管连续收集 注意正确的加样操作: 不要触及破坏凝胶面 贴壁加样 使吸管管口沿管壁环绕移动 吸管透析液 顶端 样品完全进凝胶层 5ml 红色的蛋白质 血红蛋白是有色蛋白,因此在凝胶色谱 分离时可以通过观察颜色来判断什么时 候应该收集洗脱液。这使血红蛋白的分 离过程非常直观,大大简化了实验操作 。 思考 血红蛋白提取和分离的程序可分为四大步, 包括:样品处理、粗分离、纯化和纯度鉴定 。首先通过洗涤红细胞、血红蛋白的释放、 离心等操作收集到血红蛋白溶液,即样品的 处理;再经过透析去除分子量较小的杂质, 即( );然后通过凝胶色谱 法将相对分子质量较大杂质蛋白除去,即样 品的(
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