等位基因是指位于一对同源染色的相同位置上控制着相对性状的一对基因。比如红绿色盲基因和正常的色觉基因都位于X染色体上，一个女性有两个X染色体，这两个染色体就是同源染色体。正常的色常见基因和红绿色盲基因就位于这对同源染色体的相同位置上。它们一个控制着正常的色觉，一个控制着红绿色盲，正常的色觉和红绿色盲属于相对性状。这样的一对基因就叫等位基因了。等位基因一般用相同英文字母的大写和小写来表示。比如正常色觉基因用B表示，红绿色盲基因就用b表示。又因为它们位于X染色体上，通常写成XB和Xb，B和b要写成上标。人体有23对同源染色体，其中女性是22对常染色体XX，男性有22对常染色体XY，刚才说色盲基因和正常的色觉基因位于X上，写基因时必须标明在X上，如果不是在性染色体上的基因，比如第一至22号染色体都有许多基因，那些基因是不用标明在什么染色体上的。比如人的皮肤白色（白化病）和正常色也是一对相对性状，控制它们的基因也是位于一对同源染色体的相同位置上，正常基因用A表示，白化病基因用a表示，A和a也是一对等位基因，因为它们在常染色体上，我们就不用标明在什么染色体上的，直接就用Aa表示便可。明白了等位基因之后，非等位基因就容易理解了，除了等位基因之外，其它的都是非等位基因，比如皮肤颜色正常的基因A与色觉正常的基因XB，它们既不是在一对同源染色体上，也不是控制相对性状，所以就是非等位基因，血友病基因也是在X染色体上的，用Xh表示，那么它和红绿色盲基因是等位基因吗？不是！因为它们不在同一位置上，也不是控制相对性状。最后总结一下，等位基因有三个必须要有的条件：1是在一对同源染色体上2是在相同位置上3是控制相对性状