The world leader in serving science,整体方案，带您玩转肿瘤免疫治疗研究,肿瘤治疗进入了免疫治疗的时代,传统疗法,手术切除(中早期 首选) 化疗 放疗 针对-癌细胞 相对便宜 放、化疗副作用 相对大,靶向疗法,小分子靶向药 （中晚期、有药 敏位点的病人） 单抗 针对-癌细胞 价格贵 出现耐药,免疫疗法,调动机体的免疫 系统，增强肿瘤 免疫力 针对-免疫系统 （免疫细胞） 超贵！ 疗效长，有效比 例低,联合治疗,未来新方向 多种联合手段； 如多种免疫治疗 联用；免疫治疗+ 靶向治疗等,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,2,免疫治疗可应用于不同肿瘤的治疗,膀胱癌1-3 乳腺癌4-8 结直肠癌1,4,6,9-11 胃癌8,11 头 颈 癌 12,13 肝细胞癌14,15 白血病16 肺癌6,8,11,17-19 淋巴瘤6 黑色素瘤4,6,11,15,20,21 骨髓瘤22-25 食管癌1,4,8 卵巢癌1,4,6,8,11,15,20,21,26 胰 腺 癌 5,11 前列腺癌4,27 肾细胞癌1,4,6,15,28,已已在在多多种种肿肿瘤瘤中中观观察察到到肿肿瘤瘤介介 导导的的免免疫疫系系统统抑抑制制现现象象,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,3,肿瘤免疫治疗方法一览,治疗性疫苗2,3,强化免疫 细胞功能1,细胞输注2,3,抗肿瘤 单克隆抗体2,3,利妥昔单抗 曲妥珠单抗 西妥昔单抗,过继性细胞输注3 （如CAR-T、TCR- T疗法）,调节T细胞功能2,3,细胞因子1,TG40104 Belagenpumatuce l-L5 Racotumomab6 DRibbles7,免疫检查点治疗 CTLA-4 抑制剂 2 PD-1 抑制剂2 PD-L1 抑制剂2,被动 (获得性)1,2 靶向肿瘤，基于免疫机制抗击肿瘤,主动1 直接作用于患者自身的免疫系统,免疫治疗,抗原依赖2,非抗原依赖2,CSCO 2017,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,4,肿瘤免疫治疗难点？,哪些患者适用于免疫治疗？ 有哪些Biomarker适用于免疫治疗人群筛选？ 是否有单一Biomarker进行评估？ 如何对免疫治疗预后进行监测？ ,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,5,肿瘤免疫 治疗获益,肿瘤免 疫原性,肿瘤微 环境,免疫,组库,肿瘤免疫治疗标记物的研究思路,MMR/MSI 肿瘤突变负荷,PD-L1表达 肿瘤微环境表达谱,T细胞浸润（TIL） T细胞组库,1.肿瘤免疫原性 微卫星不稳定性 肿瘤突变负荷,2. 肿瘤微环境 PD-L1表达 肿瘤微环境表达谱,肿瘤免疫环境复杂，如何评估/预测免疫治疗疗效？ 肿瘤免疫的标记物研究,3.免疫组库 免疫淋巴细胞浸润TIL T细胞组库（TCR测序）,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,6,微卫星不稳定性（MSI/MMR）肿瘤免疫治疗的“广谱”标记物,FDA批准第一个 “广谱抗癌药” Keytruda,所有dMMR/MSI-H实体瘤 结直肠癌 子宫内膜癌 胃癌 ,MSI检测方法：PCR+毛细管电泳,微卫星不稳定性常规检测方法 MMR：IHC （MLH1/MSH2/MSH6/PMS2）,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,7,微卫星稳定性并非肿瘤免疫治疗的万能biomarker,肿瘤突变负荷（TMB/TML）可能是更好的肿瘤免疫标记物？,MSI-H患者普遍(83%)具有高肿瘤突变负荷,并非所有肿瘤都是 dMMR/MSI-H，如该类型肺癌的比例很低 子宫内膜癌、胃癌、结肠癌、直肠癌,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,8,肿瘤突变负荷TMB/TML肿瘤免疫治疗焦点,肿瘤突变负荷(TMB/TML) 肿瘤每Mb基因组序列中的体细胞非同义突变累积数量； TMB越高，新抗原产生越多，肿瘤免疫原性强，T细胞反应和抗肿瘤反应越强，越适合I-O治疗,ESMO 2017, POPLAR Taqman qPCR）,OIRRA可高灵敏度地检测低表达基因， 有助于研究肿瘤微环境中重要而表达量 较低的通路,OIRRA的基因表达检测结果与qPCR， IHC一致，数据可靠 13例卵巢癌样品 （Oncomine Immune-Chef/Proton; Taqman qPCR）,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,19,赛默飞肿瘤微环境客户应用示例（Roswell Park Cancer Center + OmniSeq）,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,20,赛默飞肿瘤微环境客户应用示例（Roswell Park Cancer Center + OmniSeq）,获益预测打分 高获益：人数占比26%， 91.3%准确率； 灰区：人数占比25%； 低获益：人数占比49%， 93%准确率。,Training Dataset：88位患者，包含 黑色素 瘤，肾癌，膀胱癌，头颈癌，非小细胞肺癌； 治疗方案：一种或多种FDA-approved CPIs； 64基因免疫表达谱分型：Predictive value of the Immune Score for response to Check Point Inhibitors。,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,21,肿瘤免疫 治疗获益,肿瘤免 疫原性,肿瘤微 环境,免疫,组库,肿瘤免疫治疗标记物的研究思路,MMR/MSI 肿瘤突变负荷,PD-L1表达 肿瘤微环境表达谱,T细胞浸润（TIL） T细胞组库,1.肿瘤免疫原性 微卫星不稳定性 肿瘤突变负荷,2. 肿瘤微环境 PD-L1表达 肿瘤微环境表达谱,肿瘤免疫环境复杂，如何评估/预测免疫治疗疗效？,肿瘤免疫的标记物研究,3.免疫组库 免疫淋巴细胞浸润TIL T细胞组库（TCR测序）,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,22,T细胞组库（TCR测序）肿瘤免疫治疗研究重要方向,“使用T细胞受体（TCR）测序检测T细胞组库，发现Nivolumab 肿瘤免疫治疗响应与T细胞组库变化相关”,Cell 171, 934949, November 2, 2017,T细胞组库研究的应用方向：,肿瘤免疫检查点治疗的机理研究、标记物开发、基于TCR的免疫治疗副作用研究 免疫细胞治疗、其它免疫相关疾病（病毒类疾病、自身免疫疾病） 赛默飞免疫组库分型方案 Ion AmpliSeq Immune Repertoire Assay Plus, TCR beta,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,23,样品制备文库制备,模板制备、测序,数据分析,赛默飞TCR免疫组库NGS方案介绍,RNA起始； 血液，新鲜/冰冻组织， 分选细胞；,Ion AmpliSeq多重PCR技 术扩增CDR1/2/3区域；,400bp文库,Ion GeneStudio S5,Ion Reporter生成TCR分型报告 （Shannon Diversity, Evenness, VJ combinations等）,更全面AmpliSeq多重PCR技术，实现了CDR1/2/3区域的全覆盖； 实验和数据分析简便、快捷自动化程度高，2天获得内容丰富的分析报告； 上样量灵活兼容(10ng2.5ug)起始RNA； 数据可靠成熟的检测和分析流程，避免引物偏好带来的误差；,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,24,肿瘤免疫 治疗获益,肿瘤免 疫原性,肿瘤微 环境,免疫 组库,肠道菌群研究肿瘤免疫治疗新思路,MMR/MSI 肿瘤突变负荷,PD-L1表达 肿瘤微环境表达谱,T细胞浸润（TIL） T细胞组库,肠道 菌群,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,25,2018新年首期Science，重磅三连发,肠道菌群影响肿瘤免疫治疗效果,肠道菌群对免疫治疗有重要影响,特定肠道菌群缺乏，使肺癌、肾癌患者的抗PD-1疗法响应差1； 肠道菌群的组成和多样性，与黑色素瘤患者的免疫治疗获益相关2,3； 肠道菌群有助于免疫治疗的疗法优化，Biomarker开发和机理研究,肠道菌群的常用研究手段 16s rRNA基因测序 鸟枪法宏基因组测序；,赛默飞肠道菌群方案,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,26,1. Routy et al., Science 359, 9197 (2018)； 2. V. Gopalakrishnan et al., Science 10.1126/science.aan4236 (2017)；3. Matson et al., Science 359, 104108 (2018),扩增16s区域,文库构建,模板制备,测序,数据分析,更长、更快、数据分析更简单的赛默飞16s检测方案,为分型更准，测更多V区，reads是否够长？ 为提高效率，数据分析够不够简单？,16s客户疑问,赛默飞提供： 长达600bp reads，业界最长； 出具16s数据分析、注释、分类完整报告； 2天内完成样本到报告的工作,Ion 16s宏基因组试剂盒 (或)根据需求设计V区引物,Ion Xpress Plus 片段文库试剂盒,Ion Chef，Genestudio S5 自动化模板制备和测序平台,Ion Reporter 16s分析流程,For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.,27,可靠的赛默飞鸟枪法宏基因组方案,Routy等人在2018首期Science发表文章 “应用Ion Torrent NGS平台，和鸟枪法宏基因组测序， 发现肠道菌群与NSCLC和RCC的抗PD-1疗效相关”,Routy et al., Science 359, 9197 (2018)；,文库构建,模板制备,测序,数据分析,Ion Xpress Plus 片段文库试剂盒,Ion Chef，Genestudio S5 自动化模板制备和测序平台,数据可承接多种 成熟分析软件,For Research Use Only. Not for use in diagnostic pr