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新 疆 医 科 大 学硕 士 学 位 论 文乌 鲁 木 齐 地 区 78 例 HCV 感 染 者 基 因 型 及 亚 型 的 临 床 研 究姓 名 : 李 志 宾申 请 学 位 级 别 : 硕 士专 业 : 内 科 学指 导 教 师 : 蒋 莹2010-04摘 要乌鲁木齐地区 78 例 HCV 感染者基因型及亚型的临床研究研 究 生 : 李 志 宾 导 师 : 蒋 莹 副 教 授摘 要目 的 : 探讨丙型肝炎病毒(H CV) 基 因 型 及 亚 型 在 乌 鲁 木 齐 地 区 的 分 布 特 点 及流 行 优 势 株 、 基 因 型 在 年 龄 、 民 族 、 性 别 、 丙 型 肝 炎 感 染 途 径 、 肝 病 严 重 程 度 、 HCVRNA 载量、A LT 水 平 的 意 义 等 方 面 进 行 观 察 和 分 析 以 探 讨 HCV 基 因 分 型 的 意 义 ,为 临 床 制 定 治 疗 方 案 和 判 断 预 后 提 供 参 考 依 据 。 方法:在 82 份 抗 HCV 抗体和 HCVRNA 均 阳 性 的 血 清 标 本 中 , 分 别 提 取 HCV RNA, 通 过 PCR-反向点杂交法进行基因分 型 检 测 。 同 时 收 集 病 人 的 一 般 资 料 、 感 染 途 径 、 肝 功 能 等 资 料 进 行 登 记 。 应 用 SPSS17 for windows 软 件 , 进 行 统 计 分 析 , 计 量 资 料 应 用 t 检 验 , 计 数 资 料 应 用 2 检 验 。结果:1 . 82 例 抗 HCV 抗 体 和 HCV RNA 阳 性 标 本 中 , 有 78 例 可 进 行 基 因 分 型 , 其中 1( 1b) 型 47 例 占 60.26%, 2( 2a) 型 16 例 占 20.51%, 3 型 ( 3a8 例 , 3b 5 例 )占 16.67%, 6( 6a) 型 2 例 占 2.56%。 2. 50 岁 和 50 岁 基 因 型 总 体 分 布 差 异 经 2检 验 有 统 计 学 意 义 ( 2=13.183, P=0.004 0.05) 。 3. HCV 基因型维、汉两民族中的分 布 差 异 经 2 检 验 没 有 统 计 学 意 义 ( 2=0.729, P=0.866 0.05) 。 4. HCV 基 因 型 在 女性 、 男 性 间 的 分 布 差 异 经 2 检 验 没 有 统 计 学 意 义 ( 2=4.422, P=0.219 0.05) 。 5.经2 检 验 , 在 HCV 感染的不同肝病程度患者的基因型分布有统计学意义( 2=23.052,P=0.001 0.05) 。 6. 经 2 检 验 , HCV 基因型与感染途径有显著性差异( 2=60.270,P=0.000 0.05) 。 7.通 过 不 同 基 因 型 之 间 ALT、 HCV RNA 载 量 对 比 分 析 , 经 单 因 素方 差 分 析 , 基 因 型 之 间 ALT 水平有显著差异(F =4.539, P=0.014 0.05) 。 经 单 因 素方 差 分 析 , 基 因 型 之 间 HCV RNA 载 量 无 显 著 差 异 ( F=2.059, P=0.135 0.05) 。 结论:乌 鲁 木 齐 地 区 流 行 的 HCV 基因型为 1( 1b) , 2( 2a) , 3( 3a、 3b) , 6( 6a) 4型,1 型 为 流 行 的 主 要 基 因 型 , 2, 3, 6 型 均 占 相 当 比 例 , 初 步 说 明 乌 鲁 木 齐 地 区HCV 流 行 的 基 因 型 呈 现 多 样 性 。关键词:肝 炎 病 毒 ; 丙 型 肝 炎 ; 基 因 型 ; 亚 型 ; PCR-反 向 点 杂 交 法1.新疆医科大学医学硕士学位论文The clinical study on Hepatitis virus C genotype andsubtype of 78 HCV infected patients in Urumqi areaPostgraduate: Li Zhibin Supervisor: Associated Professor Jiang YingAbstractObjective: To study the distribution of HCV genotypes and subtypes in Urumqi areaand to know the relationship between HCV genotype and age, nationality, sex, hepatitis Ctransmission, severity of hepatopathy, serum load of HCV RNA and level of ALT.Methods: HCV RNA extracted from the Serum specimens of 82 patients with anti-HCVand HCV RNA positive was amplified by PCR, and then test the genotype of HCV RNAby using reverse dot-blot. At the same time, the general data of the patients, thetransmission approach, liver functions were registered.We applicated SPSS 17 forwindows to statistic analysis, t test for measurement data and 2 test for numeration data.Results: 1. 82 Serum specimens from HCV infected patients were examined.78 Serumspecimens can be genotyped for HCV RNA. In 78 Serum specimens, 60.26%(47/78),20.51%(16/78), 16.67%(13/78) and 2.56%(2/78) belong to genotype 1( 1b) , genotype 2( 2a) , genotype 3( 3a、 3b) and genotype 6( 6a) . 2. The different on the distributionof HCV genotypes was significant between 50years old and 50years old( 2=13.183,P=0.004 0.05) . 3. There had no significant difference between the Han nationality andthe Uygur nationality( 2=0.729, P=0.866 0.05) . 4 .The difference was not statisticallysignificant between female and male ( 2=4.422, P=0.219 0.05 ) . 5.2 test, Thedistributions of genotype in different level of hepatopathy with HCV infected wasstatistically significant( 2=23.052, P=0.001 0.05) .6. Analyze relation between HCVgenotype and route of infection. The distributions of genotype had significant difference( 2=60.270 , P=0.000 0.05) . 7. Contrastively analyze ALT level and quantitation ofHCV RNA in different genotypes, through one-factor analysis of variance, there wassignificant different of ALT levels in different genotypes( F=4.539, P=0.014 0.05) .Therewas not significant different of quantitation of HCV RNA in different genotypes( F=2.059,P=0.135 0.05) Conclusions: The HCV genotypes found in Urumqi area are 1, 2, 3, and6. HCV genotype 1 is the main genotype, and genotypes 2, 3, and 6 accounts for someproportions, that interpret the diversity of HCV genotype in Urumqi.Key words: hepatitis virus; Hepatitis C; genotype; subtype; PCR-RDB2中 英 文 缩 略 词 对 照 表英 文 缩 写 英 文 全 名 中 文 译 名aa amino acid 氨 基 酸CTL cytotoxic t lymphocyte 细 胞 毒 性 T 淋 巴 细 胞HBV hepatitis B virus 乙 型 肝 炎 病 毒HCV hepatitis C virus 丙 型 肝 炎 病 毒HC hepatic cirrhosis 肝 硬 化HCC Hepatocellular carcinoma 肝 细 胞 癌HC hepatitis C 丙 型 肝 炎NCR noncoding region 非 编 码 区ORF open reading frame 开 放 读 码 框PCR polymerase chain reaction 聚 合 酶 链 反 应RFLP restriction fragment length polymorphism 限 制 性 片 段 长 度 多 态 性IRES internal ribosome entry site 内 部 核 糖 体 进 入 位 点NS nonstructural protein 非 结 构 蛋 白ARFP alternative reading frame protein 阅 读 框 替 代 蛋 白SVR sustained virologic response 持 续 病 毒 学 应 答HVR hypervariable region 高 变 区IRF-3 interferon regulatory factor-3 干 扰 素 调 节 因 子 3RdRP RNA dependent RNA polymerase 依 赖 的 RNA 聚 合 酶UPR unfolded protein response 非 折 叠 蛋 白 反 应PKR ds RNA dependent protein kinase 依 赖 双 链 RNA 蛋 白 激 酶ISDR interferon sensitivity determining region 干 扰 素 敏 感
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