资源预览内容
第1页 / 共36页
第2页 / 共36页
第3页 / 共36页
第4页 / 共36页
第5页 / 共36页
第6页 / 共36页
第7页 / 共36页
第8页 / 共36页
第9页 / 共36页
第10页 / 共36页
亲,该文档总共36页,到这儿已超出免费预览范围,如果喜欢就下载吧!
资源描述
第七讲 InterPro蛋白功能预测和GO功能分类,IntroPro 在domain的水平上对未知的序列进行注释,例:对给定的未知功能的序列预测其功能,InterPro 主页,InterPro主页上的功能有(左边): InterPro home Text Search InterProScan Databases Documentation,Text Search,InterProScan,Databases,Documentation,在InterProScan的页面上输入未知功能的序列,等待结果,显示预测到的结果:ABC transporter,点击结果页面左边的IPR003439查看更加详细的信息,点击结果页面左边的PF00005查看更加详细的信息,GO :基因本体论三个成次: 1. biological_process (P) 2. cellular_component (C) 3. molecular_function(F),GO 主页,对前面预测到的结果进行功能分类:输入ABC transporter,显示查找到的结果,点击查看molecular_function成次(缩写F),查找到IPR003439,作业:对给定的2个未知功能的序列(unknown1, unknown2 )使用InterPro预测其功能,并用GO对功能进行分类,
收藏 下载该资源
网站客服QQ:2055934822
金锄头文库版权所有
经营许可证:蜀ICP备13022795号 | 川公网安备 51140202000112号