1本 卷 的 答 案 仅 做 参 考 ， 如 有 疑 问 欢 迎 提 出 。 后 面 的 补 充 复 习 题 要 靠 你 们自 己 整 理 答 案 了 。生 物 信 息 学 复 习 题一、填空题1、 识 别 基 因 主 要 有 两 个 途 径 即 基 因 组 DNA 外 显 子 识 别 和 基 于 EST 策 略 的 基 因鉴 定 。2、 表 达 序 列 标 签 是 从 mRNA 中 生 成 的 一 些 很 短 的 序 列 （ 300-500bp） ， 它 们代 表 在 特 定 组 织 或 发 育 阶 段 表 达 的 基 因 。3、 序 列 比 对 的 基 本 思 想 ， 是 找 出 检 测 基 因 和 目 标 序 列 的 相 似 性 ， 就 是通 过 在 序 列 中 插 入 空 位 的 方 法 使 所 比 较 的 序 列 长 度 达 到 一 致 。 比 对 的 数 学 模型 大 体 分 为 两 类 ， 分 别 是 整 体 比 对 和 局 部 比 对 。4、 2-DE 的 基 本 原 理 是 根 据 蛋 白 质 等 电 点 和 分 子 量 不 同 ， 进 行 两 次 电 泳将 之 分 离 。 第 一 向 是 等 电 聚 焦 分 离 ,第 二 向 是 SDS-PAGE 分 离 。 5、 蛋 白 质 组 研 究 的 三 大 关 键 核 心 技 术 是 双 向 凝 胶 电 泳 技 术 、质 谱 鉴 定 技 术 、 计 算 机 图 像 数 据 处 理 与 蛋 白 质 数 据 库 。二 、 判 断 题1、 生 物 体 的 结 构 和 功 能 越 复 杂 的 种 类 就 越 多 ， 所 需 要 的 基 因 也 越 多 ， C 值 越大 ， 这 是 真 核 生 物 基 因 组 的 特 点 之 一 。 （ 对 ）2、 CDS 一 定 就 是 ORF。 （ 对 ）3、 两 者 之 间 有 没 有 共 同 的 祖 先 ， 可 以 通 过 序 列 的 同 源 性 来 确 定 ， 如 果 两 个基 因 或 蛋 白 质 有 着 几 乎 一 样 的 序 列 ， 那 么 它 们 高 度 同 源 ,就 具 有 共 同 的 祖 先 。（ 错 ）4、 STS， 是 一 段 200-300bp 的 特 定 DNA 序 列 ， 它 的 序 列 已 知 ， 并 且 在 基 因 组 中属 于 单 拷 贝 。 （ 对 ）5、 非 编 码 DNA 是 “垃 圾 DNA”， 不 具 有 任 何 的 分 析 价 值 ， 对 于 细 胞 没 有 多 大 的 作用 。 （ 错 ）6、 基 因 树 和 物 种 树 同 属 于 系 统 树 ， 它 们 之 间 可 以 等 同 。 （ 错 ）7、 基 因 的 编 码 序 列 在 DNA 分 子 上 是 被 不 编 码 的 序 列 隔 开 而 不 连 续 排 列 的 。 (对 ）8、 对 任 意 一 个 DNA 序 列 ， 在 不 知 道 哪 一 个 碱 基 代 表 CDS 的 起 始 时 ， 可 用 6框 翻 译 法 ， 获 得 6 个 潜 在 的 蛋 白 质 序 列 。 （ 对 ）9、 一 个 机 体 只 有 一 个 确 定 的 基 因 组 ， 但 基 因 组 内 各 个 基 因 表 达 的 条 件 和 表 达 的程 度 随 时 间 、 空 间 和 环 境 条 件 而 不 同 。 （ 对 ）10、 外 显 子 和 内 含 子 之 间 没 有 绝 对 的 区 分 ， 一 个 基 因 的 内 含 子 可 以 是 另 一 个 基 因的 外 显 子 ， 同 一 个 基 因 在 不 同 的 生 理 状 况 或 生 长 发 育 的 不 同 阶 段 ， 外 显 子 组 成 也可 以 不 同 。 （ 对 ）11、 比 较 是 科 学 研 究 中 最 常 见 的 方 法 ， 在 生 物 信 息 学 研 究 中 ， 比 对 是 最 常 用 和 最经 典 的 研 究 方 法 。 （ 对 ）12、 ORF 一 定 就 是 CDS。 （ 错 ）13、 用 不 同 的 方 法 可 以 构 建 不 同 的 系 统 发 育 树 ,为 保 证 分 析 结 果 的 可 靠 性 ,需要 对 进 化 树 进 行 评 估 。 （ 对 ）14、 相 似 性 是 一 种 很 直 接 的 数 量 关 系 ， 无 需 实 验 验 证 。 （ 错 ）15、 基 因 树 和 物 种 树 同 属 于 系 统 树 ， 它 们 之 间 可 以 等 同 。 （ 错 ）16、 蛋 白 质 和 DNA 的 同 源 性 常 常 通 过 它 们 序 列 的 相 似 性 来 判 定 ， 如 果 两 个 基装 订 线2因 或 蛋 白 质 有 着 几 乎 一 样 的 序 列 ， 具 有 高 度 的 相 似 性 ， 那 么 它 们 一 定 是 同 源 。（ 错 ）17、 所 谓 局 部 比 对 是 找 出 两 个 被 比 较 序 列 的 最 类 似 片 段 。 （ 对 ）三 、 不 定 项 选 择 题1、 （ ABC ） 是 现 在 国 际 上 最 主 要 的 三 大 核 酸 序 列 数 据 库A. EMBL B. DDBJ C. GenBank D. NCBI E. EBI2、 RFLP 是 DNA 多 态 性 中 最 多 见 的 一 种 ， 它 产 生 的 机 制 包 括 （ ABE ）A.DNA 分 子 产 生 突 变 ， 使 某 些 酶 切 位 点 数 增 加 B. DNA 分 子 产 生 突 变 ， 使 某 些酶 切 位 点 数 减 少 C. 限 制 性 酶 切 位 点 之 间 重 复 序 列 数 目 变 异 D. 限 制 性 酶 星活 性E. 限 制 性 酶 切 位 点 前 后 的 DNA 片 断 发 生 插 入 或 删 除3、 下 面 序 列 哪 些 为 反 向 重 复 序 列 ( BD )A. GCACTTGGCACTTG B. GCACTTGCAAGTGCCGTGAACCGTGAAC CGTGAACGTTCACGC. GCACTTGCAAGTGC D. GCACTAGCTAGCGGCGTGAACGTTCACG CGTGATCGATCGCC4、 分 析 EST 序 列 时 首 要 注 意 以 下 几 点 （ ACDE ）A.EST 序 列 中 除 了 AGTC 外 ， 可 能 出 现 未 知 碱 基B.EST 只 是 单 次 测 序 ， 得 出 的 结 果 没 有 可 信 度C.EST 序 列 中 可 能 出 现 错 误 的 插 入 和 缺 失 ， 导 致 读 码 框 移 位D.某 个 EST 序 列 是 数 据 库 中 另 一 序 列 的 一 个 片 段E.某 个 EST 序 列 不 在 基 因 的 编 码 区 内5、 人 类 基 因 组 计 划 要 完 成 的 几 张 图 谱 分 别 是 （ ABCE ）A. 物 理 图 谱 B. 遗 传 图 谱 C. 序 列 图 谱 D. 生 物 图 谱 E. 基 因 图 谱6、 最 常 用 的 序 列 相 似 性 查 询 工 具 是 （ AB ）A.FASTA B.BLAST C.SWISS-PROT D.PDB E.PIR7、 下 列 哪 些 分 子 类 型 属 于 非 蛋 白 质 编 码 区 （ ABCDE ）A.内 含 子 B.卫 星 DNA C.伪 基 因 D.启 动 子 E.增 强 子8、 卫 星 DNA 的 多 态 性 是 由 （ D ） 所 决 定 的 。A. DNA 点 突 变 个 数 B. 限 制 性 内 切 酶 识 别 序 列 个 数 不 同 C. DNA 的 二 级 结 构 不同D. 重 复 单 位 不 同 E 重 复 次 数 不 同9、 真 核 基 因 组 特 点 包 括 （ ABCDE ）A. 基 因 组 大 ， 巨 大 的 非 编 码 序 列 ， 重 复 序 列 占 了 绝 大 部 分B. 基 因 结 构 复 杂 ， 无 显 著 长 度 的 开 放 阅 读 框C. 存 在 可 变 剪 接 D. CpG 岛 E. 等 值 区10、 20 世 纪 三 大 著 名 计 划 包 括 （ ACE ）A.阿 波 罗 登 月 计 划 B.卫 星 计 划 C.HGP D.肿 瘤 计 划 E.曼 哈 顿 原 子 弹计 划四 、 名 词 解 释1、 生 物 信 息 学 ： 广 义 的 生 物 信 息 学 是 指 从 事 对 基 因 组 研 究 相 关 的 生 物 信 息 的 获取 、 加 工 、 储 存 、 分 配 、 分 析 和 解 释 。 而 狭 义 的 生 物 信 息 学 是 指 综 合 应 用 信 息 科学 、 数 学 的 理 论 、 方 法 和 技 术 ， 管 理 、 分 析 和 利 用 生 物 分 子 数 据 的 科 学 。2、 蛋 白 质 组 ： 指由一个基因组，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。33、Contig：就是叠连群，是指彼此间可通过重叠序列而连接成较长片段的一组短片段，也指彼此间可通过重叠序列而连接成较长片段的一组短片段。4、序列比对：为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性，而将它们按照一定的规律排列。 五 、 简 答 题 （ 共 30 分 ）1、 下 面 的 粗 体 部 分 是 从 GenBank 中 查 出 的 记 录 的 部 分 内 容 ， 你 从 中 得 到 什 么 信息 ？ (8 分 )LOCUS AF486325 477bp DNA linear VRL 12-AUG-2002DEFINITION Human papillomavirus type 16 strain NA1 isolate PWH-Q39 E6 protein (E6) gene, complete cds.ACCESSION AF486325VERSION AF486325.1 GI:19744699SOURCE Human papillomavirus type 16REFERENCE 1 (bases 1 to 477)AUTHORS Chan,P.K., Lam,C.W., Cheung,T.H., Li,W.W., Lo,K.W., Chan,M.Y.,Cheung,J.L., Xu,L.Y. and Cheng,A.F.TITLE Human papillomavirus type 16 intratypic variant infection and riskfor cervical neoplasia in southern ChinaJOURNAL J. Infect. Dis. 186 (5), 696-700 (2002)PUBMED 12195358答 ： 第一行第一行第一行第一行：LOCUS AF486325 477bp DNA linera VRL 12-AUG-2002 LOCUS：基因座位，某一特定的基因位于染色体或其他载体所在位置，包括该基因的全部核苷酸序列。Locus 名称由一个英文字母+数字组成总长不超过 10 个字符。在数据库中locus 名称在数据库中必须是独立的、唯一的，以保证检索的不被重复。 477bp 长度 DNA：生物分子类型。有 DNA、RNA 、tRNAmRNArRNA 等 VRL：分类码 三个字母组成。以前按生物种类对序列分类，现在按序列的功能分类，EST、STS 、CON 类等。 12-AIG