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原位杂交操作流程1原位杂交操作流程:步 骤 备 注材料的固定和包埋材料的固定和包埋1、固定:将花芽浸入 20 倍于材料的 FAA 固定液中,抽气除 去材料表面附着的气泡直至材料沉于容器底部,4 C 过 夜(24h-72h) ,然后保存于 70%乙醇中。100mlFAA 固定液包含: 乙醇 50 ml 冰醋酸 5 ml 37% 甲醛溶液 10 ml DEPC-H2O 35 ml2、脱水:材料经 70%,80%,90%,100%,100%,100%乙醇 脱水,每步 60 分钟。3、透明:依次经 25%二甲苯-75%乙醇,50%二甲苯-50%乙醇, 75%二甲苯-25%乙醇,100%二甲苯,100%二甲苯, 100%二甲苯,每步 45 分钟。4、浸蜡:50%石蜡-50%二甲苯,42C 处理 24h,重复此操作 一次,移入 60C 温箱,换入纯石蜡,60C 保温四天, 每天换两次纯石蜡60C 石蜡过滤,超过 62C 可能 会破坏石蜡结构5、包埋:包埋时注意除气泡石蜡包埋块 4C 可以保存 1 年以 上切片切片1、载玻片:使用进口的处理好的载玻片。2、切片展片:42C 粘片四天。探针标记探针标记1、转绿反应(10l):线性化模板 200-300ng(2l)5x Transcription Buffer 2l5x Labeling Mix 2lRNApolymerase 1lDEPC-H2O 2.5lRnase Inhibitor 1l37 C or 42C 反应 2 小时2、收集探针:1l 10mg/ml tRNA2.5l 4M Licl75l 100%乙醇,-20C 放置 2 小时,4C,1,2000,30 分钟70%乙醇洗涤沉淀,风干,溶于 50l DEPC-H2O 中。为使探针彻底溶解,可以在 60 C 保温 15 分钟3、探针半定量:不同稀释倍数的探针和标准品点同样体积于尼龙膜,原位杂交操作流程2按照说明书进行显色。脱蜡、消化、乙酰化脱蜡、消化、乙酰化以下步骤要在无 RNA 酶的条件下进行,容器、溶液和工具均要灭菌。1、脱蜡复水:经过 100%二甲苯 20 分钟处理三次,检查 脱蜡情况,然后:75%二甲苯-25%乙醇 10 分钟25%二甲苯-75%乙醇 10 分钟100%乙醇 10 分钟100%乙醇 10 分钟90%乙醇 2 分钟80%乙醇 2 分钟60%乙醇 2 分钟 30%乙醇 2 分钟DEPC-H2O 2 分钟DEPC-H2O 2 分钟2、蛋白酶消化:37C 预热蛋白酶 K 缓冲液后加入蛋白酶 K 至 5ug/ml,37C 处理载玻片 30 分钟,DEPC-H2O 洗 3 次蛋白酶 K 缓冲液 50ml: 5ml 1M Tri-HCL pH7.5 5ml 500mM EDTA pH7.5 40ml DEPC-H2O 3、乙酰化:快速搅拌 100mM pH8.0 三乙醇胺溶液的同 时加入乙酸酐至浓度 0.25%(250l/100ml) ,5 秒后放入载玻片,室温下 5-10 分钟536l 三乙醇胺 40ml DEPC-H2O 160l 浓 HCL 搅拌时加入 100l 乙酸酐 4、脱水:2xSSC 5 分钟2xSSC 5 分钟,系列乙醇脱水(可取消) ,干燥,准备杂交。杂交杂交1、预杂交:45C 1-2 小时注意往往会产生气泡溶液 A:7.72ml(分装备用): 5000l formanmide 1000l 50% dextran sulfate 1000l 10xblock reagent 600l 5M NaCl 100l 1M Tri-HCl pH7.5 20l 500mM EDTA pH7.5溶液 B:22.8l 2.5l 20g/l polyA 1.5l 10mg/ml tRNA 18.8l probe & DEPC-H2O 80C 5mins 变性后与 A 混合2、杂交:湿室中 42C 过夜。湿室中垫 有 0.3MNaCl- 50%甲酰胺饱和 的吸水纸100l 杂交液:77.2l 溶液 A+22.8l 溶液 B。原位杂交操作流程3洗片洗片以后的操作和常规免疫组织学相似,不需要环境的特殊要求1、洗去杂交液:40ml 2xSSC 50C, 10mins40ml 2xSSC 50%formamide 50C, 30mins2、Rnase 缓冲液洗 2 次,每次 10mins3、RnaseA 处理:37C 预热 Rnase 缓冲液,加 Rnase A 溶液到终浓度 25g/ml,放入载玻片 37C 保温 30mins1000ml Rnase 缓冲液: 29.22g NaCl 0.37g EDTANa2.2H2O 1.21g Tris 加水溶解调节 pH 至 7.5 Rnase solution: 100l 10mg/ml Rnase 40ml Rnase 缓冲液4、低严谨洗:1xSSC RT, 30mins1xSSC RT, 30mins5、高严谨洗:0.5xSSC 50C, 30mins0.1xSSC 50C, 30mins检测检测1、1xPBT pH7.5 5mins, 2、5% Blocking Reagent (2ml) in (40ml) 1xPBT pH7.5 60mins, 3、1xPBT pH7.5 1mins, 4、抗体结合 2h 5、洗去未结合抗体:1xPBT pH7.5 20mins,1xPBT pH7.5 20mins,1xPBT pH7.5 20mins 6、1xTNM50 5mins 7、加底物溶液显色,RT 避光 30 mins-12h,勿晃动 8、镜检照相 9、系列乙醇脱水 10、二甲苯透明封片保存200ml 10xPBT:2ml Tween 205.8g Na2HPO4.12H2O0.6g NaH2PO4.2H2O15.2g NaCl0.04g KCl 溶解调节 pH 至 7.5(注意用 时加 400l Tween 20)2.5U/ml 抗体溶液:135l 1xPBT, 15l 10mg/ml BSA,加 Anti-DIG-AP(1l)至 2.5U/mlTNM50(pH9.5): 0.5ml 1M Tris pH9.5 0.25ml 1M MgCl2 0.1ml 5M NaCl 4.15ml dH2O底物溶液:按 2% 的体积比取 NBT/BCIP(3l)原液 到 TNM50(147l) ,每 张载片约需 150l
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