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Gaussian 是做半经验计算和从头计算使用最广泛的量子化学软件,可以研究:分子能量和 结构,过渡态的能量和结构化学键以及反应能量,分子轨道,偶极矩和多极矩,原子电荷 和电势,振动频率,红外和拉曼光谱,NMR,极化率和超极化率,热力学性质,反应路径。 计算可以模拟在气相和溶液中的体系,模拟基态和激发态。Gaussian 03 还可以对周期边界体 系进行计算。Gaussian 是研究诸如取代效应,反应机理,势能面和激发态能量的有力工具。 功能 基本算法 能量 分子特性 溶剂模型 Gaussian03 新增加的内容 新的量子化学方法 新的分子特性 新增加的基本算法 新增功能(1)基本算法 可对任何一般的收缩 gaussian 函数进行单电子和双电子积分。这些基函数可以是笛卡尔高 斯函数或纯 角动量 函数多种基组存储于程序中,通过名称调用。积分可储存在内存,外接存储器上, 或用到时重 新计算对于某些类型的计算,计算的花费可以使用快速多极方法(FMM)和稀疏矩阵技术线 性化。将原子 轨(AO)积分转换成分子轨道基的计算,可用的方法有 in-core(将 AO 积分全部存在内存里) ,直接(不 需储存积分) ,半直接(储存部分积分) ,和传统方法(所有 AO 积分储存在硬盘上) 。(2)能量 使用 AMBER,DREIDING 和 UFF 力场的分子力学计算。 使用 CNDO, INDO, MINDO/3, MNDO, AM1,和 PM3 模型哈密顿量的半经验方法计算。 使用闭壳层(RHF),自旋非限制开壳层(UHF),自旋限制开壳层 (ROHF) Hartree-Fock 波函 数的自洽场 SCF)计算。 使用二级,三级,四级和五级 Moller-Plesset 微扰理论计算相关能。 MP2 计算可用直接和 半直接方法, 有效地使用可用的内存和硬盘空间 用组态相互作用(CI)计算相关能,使用全部双激发(CID)或全部单激发和双激发(CISD)。 双取代的耦合簇理论(CCD),单双取代耦合簇理论(CCSD),单双取代的二次组态相互作用 (QCISD), 和 Brueckner Doubles 理论。还可以计算非迭代三组态(以及 QCISD 和 BD 的 四组态)的贡献。 泛函数理论(DFT),包括 LSDA, BLPY, Becke 的 1993 三参数混合方法,Becke 的 1996 单参 数混合方法,和 由此产生的变体,以及由使用者自行组合的 Hartree-Fock 和 DFT 的混合方法。 自动化的高度准确能量方法:G1 理论,G2 理论和 G2(MP2)理论;完全基组(CBS)方法: CBS-4, CSB-q, CBS-QCBS-Q/B3 和 CBS-QCI/APNO,以及一般 CBS 外插方法。 广义 MCSCF,包括完全活性空间 SCF(CASSCF),并允许包含 MP2 相关作用计算。算法的 改善使得 Gaussian 98 可处理 12 个以内的活性轨道。 广义价键结-完全配对(GVB-PP) SCF 方法。 对 Hartree-Fock 和 DFT 方法计算在取消限制后,测试 SCF 波函数的稳定性。 使用单激发组态相互作用(CI-Singles)方法,HF 和 DFT 的含时方法,和 ZINDO 半经验方法, 计算激发态能 梯度和几何优化 解析计算 RHF,UHF,ROHF,GVB-PP,CASSCF,MP2,MP3,MP4(SDQ), CID,CISD,CCD,QCISD,密度泛函和激发态 CIS 能量的核坐标梯度。以上后-SCF 方法 可以利用冻结核近似。 使用内坐标,笛卡尔坐标或混合坐标,自动进行几何优化到能量最小或鞍点结构。不论输 入结构使用何种坐标系统,优化计算的默认执行使用冗余内坐标。 使用同步过渡引导的准 Newton 方法,自动进行过渡态搜寻。 使用反应内坐标(IRC)计算化学反应路径。 对能量和几何优化进行二或三层 ONIOM 计算。 同时优化过渡态和反应路径。 使用态平均 CASSCF 进行圆锥截面优化计算。 沿着指定的反应路径对过渡结构定位能量最大点的 IRCMax 计算。直接动力学轨迹计算, 其中的经典运动方程集成了解析二级导数。频率和二级导数 对 RHF,UHF,DFT,RMP2,UMP2,和 CASSCF 方法,和用 CIS 方法计算的激发态等 的力常数(对核坐标的二次导数) ,极化率,超极化率,和偶极矩解析导数的解析计算方法。对 MP3,MP4(SDQ),CID,CISD,CCD,和 QCISD 方法的能量或梯度的数值微分,计算 力常数,极化率和偶 极矩导数。 使用任意同位素,温度,和压强做谐振分析和热化学分析。 决定振动跃迁的红外和拉曼光谱强度。(3)分子特性使用 SCF,DFT,MP2,CI,CCD,QCISD 方法求解各种单电子性质,如 Mulliken 布居分 析,多极矩,自然 布居分析,静电势,以及使用 Merz-Kollman-Singh 方法,CHelp 方法,或 CHelpG 方法由 静电势计算的 原子电荷。 用 SCF,DFT 和 MP2 方法,计算 NMR 屏蔽张量和分子的磁化系数。 振动圆二色性(VCD)强度。 分子内原子理论的成键分析和原子性质。 用传播算子方法计算电子亲和能和电离势。 CASSCF 计算中可计算两自旋状态间的近似自旋轨道耦合。(4)溶剂模型所有这些模型使用自洽反应场(SCRF)方法模拟在溶液中的分子系统。 Onsager 模型(偶极和球反应场) ,包括在 HF 和 DFT 级别解析的一级和二级导数,在 MP2,MP3,MP4(SDQ),CI,CCD 和 QCISD 级别的单点能计算。 Tomasi 等人的解析 HF,DFT,MP2,MP3,MP4(SDQ),QCISD,CCD,CID 和 CISD 能 量与 HF 和 DFT 梯度的极 化连续重叠球状反应场(PCM)模型。 在 HF 和 DFT 级别上,解析能量的 IPCM(静态等密度曲面)模型。 在 HF 和 DFT 级别上的 SCI-PCM(自洽等密度曲面)模型,用解析方法计算能量和梯度, 数值方法计算振动 频率。 2003 年,Gaussian 从 98 升级到 03,参见 Gaussian 03 简介。G03W 的界面和 G98W 相比, 没有什么变化,G98W 的用户不需要重新熟悉界面。 Gaussian 03 新增加了以下内容: 新的量子化学方法 (1) ONIOM 模块做了增强 对 ONIOM(MO:MM)计算支持电子嵌入,可以在 QM 区域的计算中考虑 MM 区域的电特性。通过算法的改善,ONIOM(MO:MM)对大分子(如蛋白质)的优化更快,结果更可靠。 ONIOM(MO:MM)能够计算解析频率,ONIOM(MO:MO)的频率计算更快。 提供对一般分子力场(MM)的支持,包括读入和修改参数。包含了独立的 MM 优化程序。 支持任何 ONIOM 模拟的外部程序。(2) 修改和增强了溶剂模块 改善和增强了连续介质模型(PCM):默认是 IEFPCM 模型,解析频率计算可以用于 SCRF 方法。此外改善了空穴生成技术。模拟溶液中的很多特性。可以对 Klamt 的 COSMO-RS 程序产生输入,通过统计力学方法,用于计算溶解能,配分系数,蒸汽压,以及其它整体 性质。(3) 周期性边界条件(PBC) 增加了 PBC 模块,用于研究周期体系,例如聚合物,表面,和晶体。PBC 模块可以对一维、 二维或 三维重复性分子或波函求解具有边界条件的 Schrodinger 方程。周期体系可以用 HF 和 DFT 研究能量 和梯度;(4) 分子动力学方法 动力学计算可以定性地了解反应机制和定量地了解反应产物分布。计算包含两个主要近似:Born-Oppenheimer 分子动力学(BOMD), 对势能曲面的局域二次近似计算经典轨迹。计算用 Hessian 算法预测和校正走步,较以前的计算在步长上能够改善 10 倍以上。还可以使用解析二级导 数,BOMD 能够用于所有具有解析梯度的理论方法。提供原子中心密度矩阵传播(ADMP)分子动力学方法,用于 Hartree-Fock 和 DFT。吸取 了 Car 和 Parrinello 的经验,ADMP 传递电子自由度,而不是求解每个核结构的 SCF 方程。 与 Car-Parrinello 不同之处在于,ADMP 传递密度矩阵而不是 MO。如果使用了原子中心基 组,执行效率会更高。这一方法解决了 Car-Parrinello 存在的一些限制,例如,不再需要用 D 代替 H 以获得能量守恒,纯 DFT 和混合 DFT 均可使用 ADMP 也可以在溶剂存在的情况 下执行,ADMP 可以用于 ONIOM(MO:MM)计算。(5) 激发态 激发态计算方面做了增强: 由于改善了在完全组态相互作用计算中求解 CI 矢量的算法,提高了 CASSCF 执行效率。 对能量和梯度计算可以使用约 14 个轨道(频率计算仍是 8 个) 。限制活性空间(RAS)的 SCF 方法。RASSCF 把分子轨道分成五个部分:最低的占据轨道(计算中作为非活性轨道 考虑)计算中作为双占据的 RAS1 空间,包含对所研究问题非常重要分子轨道的 RAS2 空 间,弱占据的 RAS3 空间,以及未占据轨道(计算中做冻结处理) 。因此,CASSCF 在 RAS 计算中分成三个部分,考虑的组态通过定义 RAS1 空间允许的最少电子数和 RAS3 空 间允许的最多电子数,以及三个 RAS 空间电子总数来产生。 NBO 轨道可用于定义 CAS 和 RAS 活性空间。对于对应成键/孤对电子的反键轨道可提供相 当好的初始猜测。 对称性匹配簇/组态相互作用(SAC-CI)方法,用于有机体系激发态的高精度计算,研究两个 或更多电 子激发的过程(例如电离谱的扰动) ,以及其它的问题。CIS,TD-HF 和 TD-DFT 的激发态 计算中可以考虑 溶剂影响。新的分子特性 (1) 自旋-自旋耦合常数,用于辅助识别磁谱的构像。 (2) g 张量以及其它的超精细光谱张量,包括核电四次常数,转动常数,四次离心畸变项, 电子自旋转动项 核自旋转动项,偶极超精细项,以及 Fermi 接触项。所有的张量可以输出到 Pickett 的拟合与光谱分析程序 (3) 谐性振-转耦合常数。分子的光谱特性依赖于分子振、转模式的耦合。可用于分析转动 谱。 (4) 非谐性振动及振-转耦合。通过使用微扰理论,更高级的项可以包含到频率计算中,以 产生更精确的结果。 (5) 预共振 Raman 光谱,可以产生基态结构,原子间连接,以及振动态的信息。 旋光性以及旋光色散,通过 GIAO 计算,用于识别手性体系的异构体。 (7) 电子圆二色性(ECD)。这一特性是光学活性分子在可见-紫外区域的差异吸收,用于归 属绝对构型。预测的光谱还可用于解释已存在的 ECD 数据和归属峰位, 含频极化和超极化,用于研究材料的分子特性随入射光波长的变化。 (9) 用量度无关原子轨道(GIAO)方法计算磁化率,它类似于电极化率,用于研究分子的顺磁/反磁特性。 (10) 预测气相和在溶剂中的电、磁特性和光谱。 (11) ONIOM 预测电、磁特性。新增加的基本算法 (1) 更好的初始轨道猜测。Gaussian 03 使用 Harris 泛函产生初始猜测。这个泛函是对 DFT 非迭代的近似它产生的初始轨道比 Gaussian 98 要好,例如,对有机体系有所改善,对金属体系有 明显改善。 (2) 新的 SCF 收敛算法,几乎可以解决以前所有的收敛问题。对于其它极少数的不收敛情 况,Gaussian 03 提供了 Fermi 展宽和阻尼方法。 (3) 纯 DFT 计算的密度拟合近似。这一近似在计算库仑相互作用时,把密度用一组原子中 心函数展开,而不是计算全部的双电子积分。
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