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资源描述
植物叶片DNA的提取DNA extraction实验一实验原理利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子 DNA分离。加入一定量的异丙醇或乙醇,基因组的大分子DNA即沉 淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出,而小分子DNA则只 形成颗粒状沉淀附于壁上及底部, 从而达到提取的目的。在提取过程 中,染色体会发生机械断裂,产生大小不同的片段,因此分离基因组 DNA时应尽量在温和的条件下操作,如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀 过程要轻缓, 以保证得到较长的DNA。一般来说,构建基因组文库, 初 始DNA长度必须在100kb以上,否则酶切后两边都带合适末端的有效片 段很少。而进行RFLP和PCR分析, DNA长度可短至50kb,在该长度 以上,可保证酶切后产生RFLP片段(20kb以下),并可保证包含PCR 所扩增的片段(一般2kb以下)。 不同生物(植物、动物、微生物)的基因组DNA的提取方法有所不同 ; 不同种类或同一种类的不同组织因其细胞结构及所含的成分不同, 分离方法也有差异。在提取某种特殊组织的DNA时必须参照文献和经 验建立相应的提取方法,以获得可用的DNA大分子,尤其是组织中的 多糖和酶类物质对随后的酶切、PCR反应等有较强的抑制作用,因此 用富含这类物质的材料提取基因组DNA时,应考虑除去多糖和酚类物 质。 实验材料和试剂 实验材料:植物幼嫩叶子。 实验所需试剂:1. 提取缓冲液:100 mmol/L TrisCl (pH8.0), 20mmol/L EDTA, 500 mmol/L NaCl, 1.5% SDS 2. 80:4:16/氯仿:戊醇:乙醇 3. RnaseA母液 4. 其它试剂:液氮、异丙醇、TE缓冲液,无水乙醇、 70%乙醇、3mol/L NaAc。实验仪器离心机各种型号的微量移液枪研钵不同型号的 eppendorf管实验步骤:1. 水稻幼苗或叶片0.1-0.2g, 剪碎, 置研钵中,加入1mL提取缓冲液,研磨成浆; 2. 吸入1.5mL EP管中,剧烈摇动混匀; 3. 60水浴保温30-60min,不时颠倒混匀; 4. 室温下10000rpm离心5min; 5. 小心吸上清于新的离心管中,加入等体积氯仿,剧烈震动; 6. 室温下10000rpm离心5min; 7. 小心将上清吸入新的离心管中; 8. 加入1倍体积异丙醇,室温下放置片刻即出现絮状DNA沉淀。 9. 8000rpm离心5min ,弃掉上清; 10.75酒精洗一次,晾干沉淀; 10. 加入5L RNaseA(10g/L), 37 10min, 除去RNA。 11. 加50-100l水融解,-20贮存。 1. 植物叶子0.1- 0.2g, 剪碎置预冷研钵中 加入1mL提取缓冲 液,研磨成浆 2. 吸入1.5mLeppendorf 管中,摇动混匀 3. 60水浴保温30-60min4. 10000rpm离心5min5. 吸上清于新的离心管中,加入等体积氯仿,颠倒混匀6. 再次10000rpm离心5min; 将上清小心吸入新的离心管中; 7. 加入1倍体积异丙醇,-20 放置10min,出现絮状DNA沉 淀;随后8000rpm离心5min , 弃掉上清;75酒精洗沉淀一 次晾干沉淀;加5L RNaseA (10g/L), 37 10min, 除去 RNA;加50-100L的TE Buffer , 取1-5L电泳检测;其余-20 贮存备用。DNA样品在0.7% Agarose胶上电泳(例图) 实验注意事项 微量移液枪的使用一定要规范,吸取氯仿等有机试剂要注意不要将试剂吸入枪中; 提取过程中的机械力可能使大分子DNA断 裂成小片段,所以为保证DNA的完整性,各步操作均应较温和,避免剧烈震荡。思考题: 1.为什么构建DNA文库时, 一定要用大分 子DNA? 2. 如何检测和保证DNA的质量?
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