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1. 生物质谱所用的内肽酶是 。(北京大学2010试题; 北京大学2009试题)A CPA B CPB C CPY D Trypsin知识要点 (1)CPA,CPB,CPY是羧肽酶A、羧肽酶B、羧肽酶 Y。羧肽酶(carboxypeptidase)是一类肽链外切酶 ,它能专一地从肽链的C-末端开始逐个降解,释放出 游离氨基酸,用于C-末端氨基酸残基分析。 (2)Trypsin是胰蛋白酶,是最常用的蛋白水解酶,专 一性强,只断裂赖氨酸或精氨酸的羧基参与形成的肽 键。用固相法测序时,用胰蛋白酶裂解得到的肽段可 以通过双功能交联剂对苯二异硫氰酸直接偶联到固 相载体上。解题思路多注意常用酶的英文及缩写根据知识要点1、2,排除 A、B、C。 参考答案D2.简述2-3种检测蛋白质间相互作用的方 法。(北京大学2010试题;中国科学院2009试题)知识要点 (1)蛋白质-蛋白质相互作用的研究已被纳入蛋白质组 学的研究范畴。 (2)蛋白质相互作用的方法包括:酵母双杂交、Far Western印迹技术、GST融合蛋白质沉降技术、蛋白 质芯片技术、等离子表面共振技术、免疫共沉淀技术 和荧光共振能量转移法等。 解题思路首先要了解蛋白质-蛋白质相互作用和蛋白质-DNA相互 作用方法的区别,然后根据知识要点选取2-3种方法进 行阐述。参考答案 (1)酵母双杂交系统(yeast two-hybird system):是 利用杂交基因通过激活报道基因的表达探测蛋白-蛋白的 相互作用。真核生物转录因子具有DNA结合结构域( BD)和转录激活结构域(AD),这两个结构域分开时仍 分别具有功能,但不能激活转录,只有它们以适当途径 在空间上较为接近时,才能重新具有转录因子活性,并 激活报道基因表达。 (2)免疫共沉淀(IP):基本原理是抗原和抗体之间专一 性地相互作用而沉淀,从而保留下来,其是一种经典的 检测蛋白质相互作用的方法。其实验过程比较简单,裂 解细胞后,加入抗体,抗原被沉淀下来后洗涤,去除非 特异性结合,再分析复合体。抗体可以是单克隆,也可 以使多克隆。 (3)蛋白质芯片(protein chip):蛋白质芯片可以用来 大规模筛选蛋白质之间的相互作用,将一个蛋白质芯片 与荧光标记的探针蛋白孵育,洗脱非特异性结合的蛋白 后,可以通过扫描芯片上的荧光点来检测稳定的相互作 用蛋白点。8. 研究蛋白质相互作用可以采用 、 、 等方 法。(北京大学2008试题) 14. 蛋白质双向电泳(2-DE)是根据蛋白质分子量大小 和 的不同来分离蛋白质的技术。(中山大学2007 试题) 5. 蛋白质芯片技术基本上是基于( )方法中的原理。 (深圳大学2009试题;中科院上海生命科学研究所 2006试题)A Northern blot B Western blotC Southern blot D Eastern blot 10. 用来研究蛋白质-蛋白质间相互作用的实验技术是( )。(中国科学院2007试题)A 酵母双杂交技术 B 原位杂交技术 C RACE技术 D SAGE 技术 25. 免疫沉淀法(immunoprecipitation)一般用于分离 ( )。(中山大学2008试题)A DNA B RNA C 蛋白质 D 脂类名词解释: 1. Edman降解(Edman degradation) (苏州大学2008试题; 浙江大学2004试题) 2. 等电聚焦(isoelectrofocusing,IEF/EF) (苏州大学2008 试题;华南理工大学2005试题) 3. 蛋白质组学(proteomics) (深圳大学2010试题;武汉大 学2003试题) 4. 蛋白质组(proteome) (深圳大学2010试题;协和医科 大学2006试题;武汉大学2005试题) 5. 双向电泳(two-dimentionlal gel electrophoresis,2-DE) (四川大学2006试题;军事医学科学院2000试题) 6. 酵母双杂交系统(yeast two-hybird system)(浙江大学 2007试题;协和医科大学2006试题) 7. SDS电泳(SDS-PAGE) (中国农业大学2006试题;南 开大学2006试题) 8. 蛋白质印迹法(Western blotting) (南开大学2006试题 ) 9. 蛋白质测序 (protein sequencing) (军事医学科学院 2000试题) 10. 免疫沉淀(immunoprecipitation,IP) (浙江大学2008 试题)2. 简述双向电泳研究蛋白质组的优缺点。 (北京大学2010试题) 6. 请例举三种蛋白质分子量的测定方法, 并简述其原理。(中国海洋大学2003试 题)答:(1)凝胶阻滞分析法(EMSA):DNA在电场中发 生迁移,至一定位置形成条带,其迁移距离与其分子 大小、形状和所带电荷有关。DNA和蛋白质结合后其 大小和形状发生变化,因而其在电泳时迁移的距离也 会发生变化,形成不同的条带;(2)DNase印迹法 :DNA与蛋白质结合后,结合部位的DNA因受到蛋白 质的保护而不被DNase降解,而未与蛋白质结合的 部位则对DNase敏感;(3)酵母单杂交:首先将已 知的特定顺式作用元件构建到最基本启动子的上游, 把报告基因连接到最基本启动子下游,然后将编码待 测转录因子cDNA与已知酵母转录激活结构域融合表达 载体导入酵母细胞,该基因产物如果能够与顺式元件 相结合,就能激活最基本启动子,使报告基因表达; (4)染色质免疫共沉淀(ChIP)它的基本原理是在活 细胞状态下固定蛋白质DNA复合物,并将其随机切 断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫 学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的 DNA片段,通过对目的片段的纯化与检测,从而获得 蛋白质与DNA相互作用的信息。10.列出三种研究DNA和蛋白质相互作用的方法并简 要说明其原理。(中国科学院2010试题;兰州大学 2008试题)13.酵母双杂交技术是利用其什么特点建立起来的? 在科学研究中有什么作用?(武汉大学2008试题) 答:酵母双杂交技术是利用真核生物转录调控因子的 组件式结构特征,因为这些蛋白质往往是由两个以上 相互独立的结构域构成,其中DNA结合结构域(BD) 和转录激活结构域(AD)是转录因子发挥功能所必需 的。单独的BD能与特定基因的启动区结合,但不能激 活基因的转录,而由不同转录调控因子的BD和AD所 形成的杂核蛋白却能行使激活转录的功能。将拟研究 的编码“猎物”蛋白的基因与AD序列结合,编码“诱饵” 蛋白的基因与BD序列结合,形成两段融合基因,并在 同一菌株内表达,若“诱饵”蛋白与“猎物”蛋白在核内 存在相互作用,就可以重新形成完整的有活性的转录 因子,从而激活报告基因的转录。因此根据报告基因 的表达与否,即可判断“诱饵”蛋白与“猎物”蛋白之间 是否有相互作用。酵母双杂交常用于研究新蛋白质的 相互作用和发现蛋白质的功能。11. 现有四种蛋白质,其相对分子质量和 等电点分别为:A,Mr=62kDa,pI=10; B,Mr=12kDa,pI=7;C,Mr=28kDa, pI=4;D,Mr=9kDa,pI=5,分别用CM- 纤维柱层析,Sephadex G-75,双向电 泳,SDS-PAGE电泳分离这四种蛋白质 ,试写出前两种方法的分离结果和后两 种方法的分离图谱。(北京大学2010试 题) 在纤维素与葡聚糖分子上结合有一定的离子基团,当 结合阳离子基团时,可换出阴离子,则称为阴离子交 换剂。如二乙氨乙基(Dicthylaminoethyl,DEAE) 纤维素。在纤维素上结合了DEAE,含有带正电荷的 阳离子纤维素OC6H14 N+ H,它的反离子为阴离 子(如Cl- 等),可与带负电荷的蛋白质阴离子进行交 换。当结合阴离子基团时,可置换阳离子,称为阳离 子交换剂,如羧甲基(Carboxymethy,CM)纤维素 。纤维素分子上带有负电荷的阴离子(纤维素O CH2 COO),其反离子为阳离子(如Na+ 等), 可与带正电荷蛋白质阳离子进行交换。11. 答:(1)四种蛋白质与CM-纤维素离子交换剂的结合 力大小为:ABDC,经过洗脱液洗脱出来的顺序 是C、D、B、A。 (2)Sephadex是以葡聚糖凝胶为介质的凝胶过滤。经过 洗脱分子量大的先洗脱出来,分子量小的后洗脱出来。 所以这四种蛋白质的洗脱顺序为A、C、B、D。 (3)SDS-PAGE与双向电泳的分离图谱为:
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