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蛋白质的-螺旋与DNA双螺旋,-螺旋:是蛋白质中最常见的一种构象,是由Pauling等根据角蛋白的X射线衍射图谱提出的。 特征如下: 1. 多肽链碳原子为转折点,以肽链平面为单位,通过两侧结合键的旋转,形成稳定的右手螺旋。2. 每圈螺旋有3.6个氨基酸残基,螺距约为0.54nm,每个氨基酸残基围绕螺旋中心轴转100,上升0.15nm(3.60.15nm0.54nm)。,3. 相邻两螺旋之间形成链内氢键,其方向与螺旋轴大致平行。氢键是由每个肽基的C=O与其前面第3个肽基的N-H之间形成的,由氢键封闭的环是13元环。在肽段中近N端的前三个亚胺基上的氢和其C端的最后三个羰基上的氧原子都不参与氢键的形成,因此,一些蛋白质肽链的N端和C端不易形成螺旋。 4.肽段中近N端的前三个亚胺基上的氢和其C端的最后三个羰基上的氧原子都不参与氢键的形成。两端不易形成-螺旋。,5.各氨基酸残基侧链R基团均伸向螺旋外侧。基团的大小、荷电状态及形状均对-螺旋的形成及稳定有影响。 6.-螺旋有左手和右手螺旋两种,天然蛋白质的绝大多数都是右手螺旋,但是主链可以存在局部的左手-螺旋,并使主链的方向发生改变,从而形成复杂的构象。由于Gly没有对称的-碳原子,这种左手-螺旋多数由Gly参与形成。,DNA二级结构双螺旋,双螺旋结构模型要点 1.主链 DNA分子由两条反向平行的脱氧多核苷酸链组成。一条链方向为3 5,另一条链为5 3。双链围绕分子中的长轴(螺旋轴)以右手方向盘绕成右手双螺旋。磷酸-脱氧核糖借磷酸二酯键相连,位于螺旋的外侧,构成螺旋的主链或骨架。糖环平面与纵轴平行,嘌呤和嘧啶碱基位于螺旋的内侧。,2. 碱基对 两条脱氧多核苷酸链的碱基,通过氢链联系,在同一平面上形成碱基对(base pairs ,bp)。 3. 螺距 双螺旋中任何一条链绕轴一周(360)所升降的距离叫做螺距。该模型螺距为3.4nm,其中包含10个碱基对,每两个相邻碱基平面的垂直距离为0.34nm,直径为2.0nm,每条链中相邻碱基对之间的旋转角为36。 4. 大沟和小沟 沿螺旋轴间观察,两条主链和碱基并不充满双螺旋的空间,双螺旋表面形成一大、一小两个凹下去的槽,前者称为大沟(Major groove),后者称为小沟(Minor groove)。,
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