我国地方猪资源网络数据库的构建黄 菊 ， 丁向东，张 勤 （中国农业大学动物科学技术学院、农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室、国家畜禽育种工程实验室，北京 100193）摘要：我国具有丰富的地方猪遗传资源，如何保护好这些宝贵的遗传资源成为了我国育种工作者的重要任务。目前，我国需亟待完善地方猪品种信息网络平台，本研究通过对我国地方猪品种资料的收集整理，旨在构建我国地方猪品种资源数据库，为我国猪遗传资源的保护和利用构建网络信息平台。系统采用了 WAMP 的网站开发环境，即Windows+Apache+Mysql+PHP，并将网站架构软件 Drupal 应用到网站开发中，实现了对网站框架结构的整合。本数据库共收集了 76 个地方猪品种，涉及每个品种从群体规模、分布状况、种质特征到品种内群体结构等的信息，系统主要功能包括检索查询、系统管理、数据管理及网络支持等。本文主要分析网络数据库的设计思想和实现过程，并给出部分功能说明。关键字：猪；种质资源；数据库；WAMP地方品种资源是生物多样性的重要组成部分，是未来育种创新工作的原始素材及人类生存和畜牧业可持续发展的物质保障之一。我国地域辽阔，在各地区多样化的生活习惯、地形、气候、环境、温度等条件的作用下，形成了各具特色的优良种质资源。丰富的猪种质资源不仅为我国畜牧业的发展，也为国际畜牧业发展提供重要的遗传多样性信息资料。为了迎合市场的需求，我国大量引进外来品种，使得地方猪品种的遗传多样性受到了威胁。20世纪90年代，已经灭绝的猪种就有2个，濒临灭绝的品种5个，数量急剧减少的品种8个 1-3。因此，在遗传资源日趋流失的今天，要保护并利用好这些资源，一个必要的措施就是对这些品种信息实施动态监控。虽然近年来，我国已陆续建立了一些畜禽种质资源数据库，但都存在不同的问题，如信息不全面、描述不够详尽、数据更新不及时等。本研究采用WAMP的开发环境，构建一个全国地方猪品种网络资源共享平台，为今后我国猪种质资源的保护和开发利用提供重要参考。1 数据资料为了保证数据信息的可靠性和时效性，我国地方猪资源数据库的数据主要来源于陈伟生、徐桂云主编的中国家畜地方品种资源图谱 、中国科技资源共享网、中国家养动物遗传资源信息网、国家农业科学数据共享中心及最新的地方猪品种资源调查结果等的最新内容。共收集到了76个地方猪品种较为全面的信息，涉及品种描述、产地分布、外貌体尺、肥育性能、繁殖性能、保种场规模、实拍图片等众多信息。大量的信息资料，难免会有重复，所以我们将这些数据导入数据库之前，要先对收集到的数据进行整理。收集的书面资料经过整理，扫描，然后用识别软件把文字识别成可编辑的文字，编辑成WORD文档即可；图片单独扫描，扫描完的图片格式为BMP，这种格式所占的空间较大，所以把这些图片转换成JPG的格式，并用图片处理软件适当调整图片大小。为了方便数据导入数据库，简化导入软件的读取识别过程，我们将图片统一命名，如民猪公猪图片命名为1-1，民猪母猪图片命名为1-2，八眉公猪图片命名为2-1，八眉母猪图片命名为2-1，以此类推，直到命名完76个地方品种。 2 数据库结构设计在前期数据的收集和整理的基础上对数据进行分析,得出许多个关键数据字段，如：名称、品种类型、品种描述、审定日期、主要分步、原产地、产区生态环境、品种利用现状、被毛颜色、乳头对数、体高、体长、胸围、猪成年重、性成熟期、适时配种期、妊娠期、屠宰体重、屠宰率、眼肌面积、背膘厚、肉质pH1、肌肉剪切力、系水力、肉色、品种保存类型、品种分布省份、规模、 国家级猪遗传资源保种场名单及相关信息、国家级猪遗传资源保护区名单及相关信息等。在大量的地方猪品种信息中，为了使这些信息既能有机的联系，又便于技术处理，系统设计了7个数据库（表）：即省份/区域表、品种信息表、品种-原产地对应表、品种-分布省份对应表、资源场信息表、资源场-品种信息对应表、保护区-品种信息对应表。各表间以系统编号ID、品种名称或省份名称为关键字段，实现相互间的关联。再根据各信息的长度,设计数据库表中各个字段的长度和类型。此外，我们还制定了一些约束。如省份编号、ID、资源场编号和保护区编号被设为主关键字；省份编号、省份名称、品种编号、品种名称、场编号、场名称、保护区编号和ID被设定唯一约束字段。数据库的信息，可以从网站后台操作系统直接录入数据，也可以导入外部数据。由于收集的信息均以Word文档或Excel表格的形式保存，我们选择利用已有的Excel表，将数据和图片直接导入MySQL数据库中。需注意的是，准备导入的表需事先整理成与数据库中相应表的格式一致 4。3 网络信息化平台3.1 开发环境整个网络信息平台的搭建，采用了Windows+Apache+MySQL+PHP的网站开发环境，再将Drupal内容管理系统应用到本研究中，从而实现了基于Drupal系统的网站框架结构和网站部分功能。友好的图形界面，使用者无需掌握数据库命令，只用鼠标点击等的简单操作及可完成操作。3.2 系统设计从应用的角度来说，建立数据库并不是我们的最终目的，我们的目的是为了让用户在友好的界面下，通过网站获得所需要的信息，因此，建立合适有效的检索系统变得尤为重要。我们分别从功能和界面两个方面对网站进行了设计。网站主要具有两大方面的功能。普通用户具有查看和检索的功能，管理员除去拥有和普通用户相同的功能外，还有以下四个功能：（1）内容管理：查看、编辑和删除所有网站内容、控制发表行为等操作；（2）站点创建：指定默认主题、设置区块内容及站点分布位置、控制网站导航菜单、创建菜单区块；（3）站点配置：更改网站基本信息，例如：口号、任务、首页等，启用或禁用网站的简洁链接，控制网站如何处理错误，包括403（禁止访问）/404（未找到）错误以及php错误报告；（4）用户管理：控制用户可以在网站上执行的操作。为了让普通用户拥有便捷、直观的检索界面，我们把所有的检索入口都直接呈现在主页上，包括顶部、左侧栏、右侧栏和中间地图导航四部分。 （见图1）顶部信息包括：网站logo和主链接（首页、品种、资源场、保护区和管理） 。左右侧栏分别是按品种类型和分布省份分类的链接。中间部分则为地图导航，用户可以点击各省份链接到所要搜索的地方猪品种信息，这部分要实现动态效果。此外，我们还统一设计了每个品种信息显示的格式，在相关文本描述按一定顺序排列后，我们将繁多的性状参数进行归类划分，采用表格的形式呈现给用户，这样既保证了系统的简单、易用，又具有一定的可扩充性。图1 网站首页3.3 系统功能实现我国地方猪品种资源库具有丰富的检索入口：品种、资源场、保护区、分布省份、品种类型、资源场分布省份，只要点击相关的字段，即可检出相关信息。同时还提供较为模糊的检索方式，如点击主页右侧栏的某一省份，不仅可以检出分布在该省份的猪种，还可以查询到分布在该省的所有国家级猪遗传资源保护区和资源场的相关信息（点击动态地图上的某一省份，也可实现相同的检索功能） 。值得一提的是，我们还创新性的建立了以图片为入口的检索，即用户并不需要记得猪的具体名称，只记得猪的大致样貌，也能通过我们的网站完成查询。其只需点击首页左侧栏导航内的图片滚动效果（或滚动图片） ，网站就会把所有收录的地方猪图片如图2显示那样，以滚动图片的形式向用户展示，选中与用户记忆中相近的猪图片，系统就会显示选中品种的详细信息。图2 网站滚动图片实例4 讨论基于对我国地方猪种质资源多样性的保护和利用，我们搜集了大量的品种信息，并进行整理、分类，初步构建了这个中国地方猪品种资源信息库。相对于目前国内有关种质资源数据库，本资源信息库具有简洁不冗余、信息全面、综合性强等特点。它不但弥补了同类数据库存在的数据不全面、信息单一、更新不及时、缺少后期维护等方面的不足，还有机地把资源场和保护区的信息联系起来，能够最大程度地满足不同用户的不同需求。这样一个共享平台的搭建，更是克服了资源信息的相对封锁、保密的尴尬局面，将原本分散的信息变成集中、方便查询的信息，可以起到促进交流，提高信息使用效率的作用。同时，也使得畜牧科研人员和生产者对地方猪品种有更全面的了解，这对于优异资源使用范围的拓宽、新品种的培育、品种资源保护方案的制定、大众认知的提高都具有一定的积极作用。因此，不管是从实际情况还是从长远发展来看，都具有一定意义。参考文献：1 耿社民,刘小林.中国家畜品种资源纲要.北京:中国农业出版社,20032 陈瑶生,潘玉春.中国家畜遗传资源保护与利用.北京:中国农业科学技术出版社,2003 3 MaYue-hui and Shi Jian-zhong.No time to delay:conservation of livestock genetic resource. Animal biotechnology bulletin,2004,9(2):347-3514张燕宁.Access数据库在高校院级科研管理中的应用J.大众科技,2006,(4):41-42,54