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DICOM数据格式,张静远,DICOM数据格式,DICOM全称为医疗数位影像传输协定(Digital Imaging and Commun- ications in Medicine),是一组通用的标准协定,在对于医学影像的处理、储存、打印、传输上。它包含了档案格式的定义及网络通信协定。DICOM是以TCP/IP为基础的应用协定,并以TCP/IP联系各个系统。两个能接受DICOM格式的医疗仪器间,可借由DICOM格式的档案,来接收与交换影像及病人资料。 AS = Angioscopy 血管镜 BI = Biomagnetic Imaging 生物磁场成像 CD = Color Flow Doppler 彩色血流多普勒 CF = Cinefluorography 荧光透视 CR = Computed Radiography 计算机X光摄影 CS = Cystoscopy 膀胱镜 CT = Computed Tomography 电脑断层摄影 DD = Duplex Doppler 双工多普勒 DG = Diaphanography 透视摄影,DICOM文件结构,文件头,文件头包含了标识数据集合的相应信息,由128字节的文字导言构成。如果该导言不传达信息,可由十六进制的00填充。 文件头之后是DICOM前缀,内容是字符串“DICM”,表示是DICOM文件。 文件头之后是数据集合,文件头也可以缺省。,数据集合,标签:4字节无符号整数,分为组号和元素号 VR:数据类型 数据长度:2字节或4字节 数值:长度为偶数字节,28001100,5553,0200,0001,28001100:图像高度标签 5553:数据类型 0200:数据长度为2字节 0001:数值为256,DICOM处理流程,头动校正,标准化,平滑,头动校正,1、解头动参数 2、再切片,1、解头动参数,由于头动校正是处理的是同一被试,所以可以看做是刚性变换,分为平移和旋转两部分,方程为,T为平移参数,R为相对坐标轴的旋转参数,之后再通过高斯迭代,可以求解方程,其中表示第i个体素的坐标,M为变换矩阵,f(*)表示资源图像的灰度值,g(*)表示参考图像的灰度值,q7为灰度平衡参数。q7引入是为了平衡两幅图像的灰度。向量q扩展到七维。,2、重切片,重切片包括重新分割空间和计算新像素的灰度值。 计算新像素的灰度值的主要方法有:最近相邻法(nearest neighbor)、三线性插值法(tr-i linear interpolation)和正弦插值法(sinc interpolation)等,选择何种方法根据计算精度和计算能力来定。,标准化,由于被试间脑结构存在差异,因此需要用带有整体形变的仿射变换和局部非线性变换将它们同一化到标准脑上 SPM 软件中采用了Ta2lairach 和Tournoux所定义的脑图谱空间作为变换的基础,制作了不同成像方法(如MRI、PET 和CT 等) 的标准脑基准图像,用户做图像标准化时,可根据具体的成像方法选择相应的基准图像,平滑,空间平滑就是将数据在空间上用一个光滑的函数(通常是Gauss函数 )去卷积 作用: 1、提高信噪比 2、符合Gauss随机场的要求 3、消除不同被试脑结构之间的细微差别,
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