分子生物学复习题第一章 1、蛋白质的三维构造称为构象（confoaion）,指的是蛋白质分子中所有原子在三维空间中的排布，并不波及共价键的断裂和生成所发生的变化。2、维持和稳定蛋白质高档构造的因素有共价键(二硫键)和次级键,次级键有4种类型，即离子键、氢键、疏水性互相作用和范德瓦力。3、蛋白质的二级构造是指肽链中局部肽段的构象,它们是完整肽链构象(三级构造)的构造单元,是蛋白质复杂的立体构造的基本,因此二级构造也可以称为构象单元。螺旋、折叠是常用的二级构造。 4、某些肽段有形成螺旋和折叠两种构象的也许性（或形成势)，此类肽段被称为两可肽。5、两个或几种二级构造单元被连接肽段连接起来，进一步组合成有特殊几何排列的局域立体构造,称为超二级构造（介于二、三级构造间)。超二级构造的基本组织形式有,和等3类 、蛋白质家族（fmly) :一类蛋白质的一级构造有3以上同源性,或一级构造同源性很低,但它们的构造和功能相似,它们也属于同一家族。例如球蛋白的氨基酸序列相差很大,但属于同一家族。超家族(suprfaiy)：有些蛋白质家族之间,一级构造序列的同源性较低,但在许多状况下,它们的构造和功能存在一定的相似性。这表白它们也许存在共同的进化来源。这些蛋白质家族属于同一超家族。7、构造域是一种连贯的三维构造,是可互换并且半独立的功能单位,在真核细胞中由一种外显子编码，由至少40个以上多至20个残基构成最小、最紧密也最稳定的构造，作为构造和功能单位，会反复出目前同一蛋白质或不同蛋白质中。8、蛋白质一级构造所提供的信息有哪些?螺旋、折叠各自的特点？第二章1、DNA是由脱氧核糖核苷酸构成的长链多聚物，是遗传物质。具有下列基本特性：具有稳定的构造，能进行复制，特定的构造能传递给子代;携带生命的遗传信息，以决定生命的产生、生长和发育;能产生遗传的变异,使进化永不枯竭。2、DN链的方向总是理解为从端到3O端。DNA的一级构造事实上就是DNA分子内碱基的排列顺序。 、D是双螺旋构造：主链由脱氧核糖和磷酸基团以3,5磷酸二酯键交互连接构成的，在双螺旋的外侧，碱基在内侧，碱基必须配对。一条链绕着另一条链旋转、盘绕，一条链上的嘌呤与另一条链上的嘧啶互相配对，嘌呤与嘧啶以氢键保持在一起。4、双螺旋DNA熔解成单链的现象称为D变性。已经变性的NA在一定条件下重新恢复双链的过程称为复性。5、染色质是以双链A为骨架,与组蛋白(hison）、非组蛋白(no-histon)以及少量的多种RN等共同构成丝状构造。在染色质中,DA和组蛋白的构成非常稳定,非组蛋白和RNA随细胞生理状态不同而有变化。 、常染色质是在细胞间期核内染色体折叠压缩限度较低，处在伸展状态,碱性染性着色较浅而均匀的那些染色质。重要是单一拷贝和中度反复序列。异染色质是在细胞间期核内染色质压缩限度较高,处在凝集状态，碱性染料着色较深的部分。7、核小体是构成真核生物染色质的基本构造单位,是DNA和蛋白质构成的紧密构造形式。8、RNA的种类及其各自的特点?第三章 基因和基因组1、基因被定义为转录功能单位,是编码一种可扩散产物的一段DNA序列，其产物可以是蛋白质或RA。一种完整的基因应当由两部分构成,即编码区和调控区。 2、基因组是一种生物染色体内所有遗传物质的总和，涉及构成基因和基因之间区域的所有。所谓总和，还应当指该物种的不同DN功能区域在NA分子上构造分布和排列的状况。基因组以及基因一般以A的长度和序列表达。3、病毒基因组的构造特点:(1）与细菌相比较，病毒的基因组很小，所含遗传信息量较小，只能编码少数的蛋白质。（2)病毒基因组由DNA或N构成。核酸的构造可以是单链或双链、闭合环状或线状分子。（3)常有基因重叠现象,即同一A分子序列可以编码2种或3种蛋白质分子。4、细菌基因组的一般特点）基因组一般仅由一条环状双链N分子构成。但现发既有越来越多的线形基因组。2）只有一种复制起始点。3)有操纵子的构造。数个有关（参与一种生化过程）的构造基因串联在一起,受同一调控区调节,合成多顺反子mRN。4）编码蛋白质的构造基因是单拷贝的，但RNA基因往往是多拷贝的。5）非编码的D所占比例少，类似病毒基因组。6）基因组DNA具有多种调控区，如复制起始区、复制终结区、转录启动子、转录终结区等特殊序列。7)与真核生物类似,具有可移动的DNA序列。、真核生物基因组特点(1）基因组的分子量大。低等真核生物大概17-108b,而高等真核生物为510810 bp（)真核生物细胞往往有诸多染色体，一般呈线状。每个染色体A有诸多复制起始点。(3)细胞核DN与蛋白质稳定地结合成染色质的复杂构造。染色质内除了具有DA和组蛋白外，尚有大量非组蛋白。(4）由于存在核膜，细胞被分隔成细胞核和细胞质,因此,在基因体现中,转录和翻译在时间和空间上是分隔的，不偶联的。(5)基因组的大量序列是非编码序列,有大量反复序列。（ ）真核生物的蛋白质基因往往是单拷贝存在,转录产物是单顺反子mRA。()存在某些可移动的A序列。(8)绝大多数真核生物基因具有内含子,因而基因编码区是不持续的。（9）真核生物基因内部也也许具有大量的反复序列。、基因家族:一组功能类似、构造具有同源性的基因称为基因家族。基因家族的分类有多种方式。基因家族各成员在构造上非常类似，具有保守性，如rRNA基因家族,但基因之间的间隔区可以有很大的长度差别和序列差别。重要的基因家族:rNA基因家族、5S rRNA基因、组蛋白基因家族、珠蛋白基因家族、生长激素基因家族、超基因。7、超基因(supegene）是指一组由多基因和单基因构成的更大的基因家族。在高等真核细胞中,一种基因簇内具有数百个功能有关的基因,它们也许是由基因扩增后构造上轻微变化而产生的，这些基因的构造有限度不等的同源性,功能上仍保持原始基因的基本功能,或者进化成具有有关而不同的新功能，这样的一簇基因称为超基因家族。有免疫球蛋白超基因家族、核受体超基因家族、细胞因子超基因家族等。 8、在初始转录产物hnRN加工产生成熟的mR时,被切除的非编码序列称为内含子(inton)。在成熟的RN或蛋白质中存在的序列称为外显子(exon）。基因的不持续性是真核生物基因所特有的，但不是所有真核生物基因都一定具有这种不持续性。 9、内含子的功能：（1)具有可阅读框架(R)，内含子的RF也许编码酶或蛋白质，其中涉及逆转录酶、成熟酶。()具有多种剪接信号码，内含子编码的成熟酶直接参与内含子自身的剪接功能。（3）对基因体既有影响，内含子对基因体现在多种水平上施加影响。内含子中的增强子序列增长了基因转录的起始反映。1、人类基因组筹划(man geom project,GP)的总体目的是要完毕人类所有24条染色体109bp序列的分析。具体涉及:人类基因组作图（遗传学图谱、物理图谱) 。对基因组DA进行切割和克隆。测定基因组的所有DNA序列。基因的鉴定。信息系统的建立、信息的储存和解决以及相应软件的开发。11、构造基因组学(stctal genomics)以全基因组测序为目的的基因构造研究,论述基因组中基因的位置和构造,为基因功能的研究奠定基本。12、功能基因组学（futional gnomcs）是运用构造基因组学提供的信息,以大规模实验措施及记录与计算机分析,全面系统地分析所有基因的功能。13、蛋白质组(potme)是一种基因组在特定细胞内所体现的蛋白质。对于一种生物来说，它的基组DNA基本上是恒定的,但蛋白质组是动态的。也就是不同组织的细胞中蛋白质组是不同的,在同一细胞的不同生长状态、病理状态下也是不同样的。蛋白质组只指某一特定期间内的蛋白质集合体。 14、生物信息学是用数理和信息科学的观点、理论和措施去研究生命现象,组织和分析呈指数增长的生物学数据的一门学科。生物信息学位于生物、计算机、数学等多种领域的交叉点上，其研究目的是揭示“基因组信息构造的复杂性及遗传语言的主线规律”。 生物信息学涉及了基因组信息学、蛋白质构造模拟和药物设计等3个构成部分。目前的研究涉及下面几种方面： 有关信息的收集、储存、管理与提供。新基因的发现和鉴定。 非编码区的信息构造分析。大规模基因功能体现谱的分析。蛋白质分子空间构造预测、模拟和分子设计。药物开发。第四章生物大分子的互相作用、生物大分子之间特异性地、可逆解离地形成复合物的能力是生命活动的基本，这种特异性的、可逆的互相作用被称为生物分子的辨认。2、参与大分子互相作用的非共价键类型 ()疏水性互相作用 ，(2)范德瓦力,（)氢键,（4)静电互相作用。3、参与蛋白质互相作用的构造域有:BR(rat cner suscetbliy ene C trmins)构造域、Lm构造域、S构造域、H2构造域、Bro构造域、POZ构造域、W构造域、锚蛋白反复序列(ankyrin rpat,ANK）的构造域、 PH构造域、环指构造域(rin figrdoain）。4、蛋白质与RNA的辨认以“间接读出”(indrct redt)机制为主。所有的RNA构造，涉及线状序列、发夹、膨泡、内环、假结、双螺旋等都可以作为蛋白质专一性辨认的靶构造。5、多种DNA结合蛋白，特别是转录因子(transripton cor）都具有与DN互相作用的区域,称为NA结合构造域（DNA-indigdoain),简称结合域。6、对基因进行调节、控制的蛋白质,如多种普遍性（或基本)转录因子、基因调控因子，相对于作用于它的靶位点N序列而言，广义地称为反式作用因子(tn-cin factr)。7、锌指构造蛋白质是自然界中广泛分布的一类含锌蛋白质,构成了一种超家族。锌指构造家族蛋白,以其形状和结合锌的复杂性，特别是锌指四周体构造,可以分为C2H2,4和6等几种类型。8、亮氨酸周期反复不在于形成一种疏水面,而在于两个蛋白质的两个螺旋之间，依托亮氨酸周期性侧链交错相插,螺旋靠拢,在疏水作用之下形成一种稳定的非共价结合的拉链构造，即所谓的亮氨酸拉链(leucie ipe）。 第五章基因工程原理、基本概念(1）基因工程:是用酶学措施，把天然的或人工合成的、同源或异源的DNA片段与具有复制能力的载体分子（如质粒、噬菌体、病毒等)形成重组DNA分子，再导入不具有这种重组分子的宿主细胞内,进行持久而稳定的复制、体现,使宿主细胞产生外源D或其蛋白质分子。（）基因组DNA文库（P5）：是某毕生物体的染色体所有DN序列被随机切割成合适大小的片段后,插入到载体内构成的DA文库。（3）cDNA基因文库(P10):一群具有重组NA的细菌，质粒或噬菌体的克隆，来自某细胞类型所有的mRA。()扣除文库（P163）:将两重不同组织来源的mRN进行比较,用扣除杂交排除相似部分,即共同体现的那部分mRN，选出剩余有差别的、特异体现的mRNA,构建成cDA文库,称为cNA扣除文库。(5)分子杂交（171）:指具有一定同源性的两条核酸单链在一定条件下（合适的温度和离子强度)可按碱基配对的原则退火形成双链的过程。(6）PC技术原理:PC技术是运用两种寡核苷酸引物,分别与双链DNA片段的两端互补,形成DNA聚合酶反映中的模板和引物的关系。()物理图谱：DNA片段上限制性内切酶酶切位点的图谱,表达多种限制性内切酶辨认位