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2018年硕士生入学考试专业基础课大纲考试科目名称:基因组信息学与生物统计 考试科目代码:814一、 考试要求 掌握常用的生物统计方法,了解基因组信息学中的基本数据类型,能运用所学的基本理论和实验技能,说明和解决基因组信息学中相关的问题。二、 考试内容(一)基因组信息学部分1)基因组信息学中生物学基础a. DNA的结构、分子生物学中心法则b. 基因组结构与基因表达调控2)人类基因组及基因组数据库a. 人类基因组计划及测序策略b. NCBI及Ensembl数据库、UCSC基因组浏览器c. ENCODE计划、TCGA计划3) 基因组信息分析a. 真核生物基因组特点b. 基因组序列分析c. 基因识别方法d. 非编码区域分析与调控元件识别4) 基因芯片数据分析a. 基因芯片分类与数据表示b. 基因芯片数据预处理c. 基因表达差异的显著性分析d. 基因表达谱聚类分析e. 基因表达数据的分类分析f. 主成分分析PCA5) 新一代高通量测序数据分析a. 了解新一代高通量测序技术的基本原理b. 了解ChIP-Seq技术的基本原理及基本分析工具 (Bowtie、MACS)c. 了解RNA-Seq技术的基本原理及基本分析工具 (tophat、cufflinks)(二)生物统计部分1)生物统计学的基本知识a. 生物统计学概念b. 生物统计学术语2)实验资料的整理与统计描述a. 实验资料的收集与整理b. 统计图表的应用c. 实验资料特征数的计算3) 概率与概率分布a. 概率基础知识b. 几种常见的理论分布 (正态分布,二项分布,泊松分布)c. 抽样分布的特征以及中心极限定理4) 统计推断a. 假设检验的原理与方法b. 样本平均数的假设检验c. 样本频率的假设检验d. 参数的区间估计与点估计e. 方差的同质性检验5) 2检验a. 2检验的原理与方法b. 正态分布和二项分布的拟合优度检验c. 计数资料的2检验6) 方差分析a. 方差分析的基本原理b. 单因素方差分析c. 二因素方差分析d. 方差分析的基本假定和数据转换7) 简单直线回归与相关分析a. 回归和相关的概念b. 直线回归分析c. 直线相关8) 多重线形相关与回归a. 多重线性相关与回归中涉及的统计量的概念和意义b. 多重回归分析c. 多重相关分析三、 试卷结构a) 考试时间180分钟,满分150分b) 基因组信息学与生物统计各占75分c) 题型结构:a: 填空题(30分)b: 解答题(包括简答与计算题)(120分)四、 参考书目1. 乔纳森.佩夫斯纳著,孙之荣译,生物信息学与功能基因组学,化学工业出版社。2. 孙啸、陆祖宏、谢建明,生物信息学基础,清华大学出版社。3. 李春喜,王志和等,生物统计学(第四版),科学出版社。4. 杜荣骞编,生物统计学第三版,高等教育出版社
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