R语言入门R是开源的统计绘图软件，也是一种脚本语言，有大量的程序包可以利用。R中的向量、列表、数组、函数等都是对象，可以方便的查询和引用，并进行条件筛选。R具有精确控制的绘图功能，生成的图可以另存为多种格式。R编写函数无需声明变量的类型，能利用循环、条件语句，控制程序的流程。R网络资源：R主页: http:/www.r-project.org R资源列表 NCEAS http:/www.nceas.ucsb.edu/scicomp/software/r R Graphical Manual http:/bm2.genes.nig.ac.jp/RGM2/index.php 统计之都: http:/cos.name/ QuikR http:/www.statmethods.net/ 丁国徽的R文档: http:/www.biosino.org/R/R-doc/ R语言中文论坛 http:/rbbs.biosino.org/Rbbs/forums/list.page 一、用函数install.packages()， 直接输入就可以联网，第一次的话之后选择镜像，然后选择包下载即可如果已经连接到互联网，在括号中输入要安装的程序包名称，选择镜像后，程序将自动下载并安装程序包。例如：要安装picante包,在控制台中输入install.packages(picante)已经安装了？二. 安装本地zip包路径：Packagesinstall packages from local files选择本地磁盘上存储zip包的文件夹。(文件，运行R的脚本，选择所在文档)三.调用程序包在控制台中输入如下命令 library(“picnate”) 程序包内的函数的用法与R内置的基本函数用法一样。四.程序包内部都有哪些函数？分别有什么功能？查询程序包内容最常用的方法：1 菜单帮助Html帮助；2 查看pdf帮助文档五.查看函数的帮助文件函数的默认值是什么？怎么使用？使用时需要注意什么问题？需要查询函数的帮助。1 ?t.test直接打开相关函数的说明和使用模板。2 RGuiHelpHtml help同样的效果，同上3 apropos(t.test)合理使用T检验，五种模式的T检验4 help(t.test)帮助同1-25 help.search(t.test)有关T检验的一切东西都可以查出来。6 查看R包pdf手册六、帮助很强大 lmstats #函数名及所在包 Fitting Linear Models #标题 Description #函数描述 Usage #默认选项 Arguments #参数 Details #详情 Author(s) #作者 References #参考文献 Examples #举例七、R图形界面：R commander 1安装R commanderinstall.packages(Rcmdr) 2 R将自动下载并安装Rcmdr所需的所有程序包调用R Commander图12 R commander界面library(Rcmdr)八、R的函数R是一种解释性语言，输入后可直接给出结果。功能靠函数实现。函数形式: 函数(输入数据，参数= )如果没有指定，则参数的以默认值为准。例如:平均值 mean(x, trim = 0, na.rm = FALSE, .)线性模型 lm(yx, data=test)每一个函数执行特定的功能，后面紧跟括号，例如：平均值 mean()； 求和 sum()； 绘图 plot() ；排序 sort()。除了基本的运算之外，R的函数又分为”高级”和”低级”函数，高级函数可调用低级函数,这里的”高级”函数习惯上称为泛型函数。如plot()就是泛型函数，可以根据数据的类型，调用底层的函数，应用相应的方法绘制相应的图形。这就是面向对象编程的思想。查询的方法：HelpHtml helppackageslog()log10()exp()sin()cos()tan()asin()acos()binom.test()fisher.test()chisq.test()friedman.test()mean()sd()var()glm(yx1+x2+x3, binomial).九、赋值与注释与对象起名- 右边的值赋值给左边的变量或者对象 ； # 注释注释部分不会编译R处理的所有数据、变量、函数和结果都以对象的形式保存。1.区分大小写,注意China和china的不同。2.不能用数字作为变量，对象也不能用数字开头，但是数字可以放在中间或结尾，如2result与result2，后者是合法的。3.建议不要用过短的名称。可以用”.”作为间隔，例如 anova.result1。4.不要使用保留名：NA, NaN, pi, LETTERS, letters, month.abb, month.name十、元素与对象的类1.对象是由各元素组成的。每个元素，都有自己的数据类型。2.元素种类数值型 Numeric 如 100, 0, -4.335字符型 Character 如“China”逻辑型 Logical 如TRUE, FALSE因子型 Factor 表示不同类别复数型 Complex 如：2 + 3i3.对象的类class：因子(factor) 因子是一个分类变量c(a,a,b,b,c)向量(vector)一系列元素的组合。如 c(1,2,3); c(a,a,b,b,c)矩阵(matrix)二维的数据表，是数组的一个特例：x - 1:12 ; dim(x) = 3) 数据框(dataframe)是由一个或几个向量和（或）因子构成，它们必须是等长的，但可以是不同的数据类型。每个数据表可以看作一个数据框(dataframe)。每一行(row)作为一个记录(entry)，每一列(column)作为一个向量(vector)。由很多不同类型的向量组成，如字符型，因子型，数值型。如何生成数据框？两种办法：(1)从外部数据读取；(2)各类型因子组合成数据框。列表(list)列表可以包含任何类型的对象。可以包含向量、矩阵、高维数组，也可以包含列表。十一、运算符数学运算运算后给出数值结果： +, -, *, /, (幂)比较运算运算后给出判别结果： (TRUE FALSE)：, , =, =（=是计算机编程的二元运算符。当左边的内容与右边的内容相同时，返回1。其余时候返回0。=是判断两个值大小是否相同的运算符。）, !=不等于逻辑运算与、或、非：!, &, &, |, |十二、数据的读取1.最为常用的数据读取方式是用read.table() 函数或read.csv()函数读取外部txt或csv格式的文件。 txt文件，制表符间隔； csv文件，逗号间隔。一些R程序包（如foreign）也提供了直接读取Excel, SAS, dbf, Matlab, spss, systat, Minitab文件的函数。2.read.csv()的使用例：test.data-read.csv(D:/R/test2.csv,header=T)header=T表示将数据的第一行作为标题。read.table(file=file.choose(),header=T)可以弹出对话框，选择文件。3.数据量较大时用read.table函数从外部txt文件读取第1步将Excel中的数据另存为.txt格式（制表符间隔）或.csv格式。第2步用read.table()或read.csv()函数将数据读入R工作空间，并赋值给一个对象。4.例子：mydataframe-read.csv(F:/KAGGLE1/train.csv,header=F)命名读取函数数据位置文件夹名称是否读取头（T/F）十三、向量、矩阵和数据框的创建有时需要对读入的数据进行操作，将某一向量转换成矩阵，如条件筛选，此时将遇到向量、矩阵和数据框的生成、条件筛选等。1.1四种类型的向量：字符型character-c(China, Korea, Japan, UK, USA, France, India, Russia) ；数值型numeric-c(1, 3, 6, 7, 3, 8, 6, 4)； 逻辑型logical-c(T, F, T, F, T, F, F, T)；复数型略。1.2创建向量 用X-c()函数或者c() , rep() , seq() , ”:”c(2,5,6,9) rep(2,times=4) seq(from=3, to=21, by=3 ) 1 3 6 9 12 15 18 21“：” 1:15 #意思是 1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15通过与向量的组合，产生更为复杂的向量。 rep(1:2,c(10,15)1.3向量创建产生随机数runif(10, min = 0, max= 1) rnorm(10, mean = 0, sd = 1)1.4几个随机数的相关函数概率密度 dunif(x, min=0, max=1, log = FALSE) 累积函数 punif(q, min=0, max=1, )分位数 qunif(p, min=0, max=1, ) 随机均匀分布 runif(n, min=0, max=1)2.矩阵的创建生成矩阵的函数 dim()和matrix()dim() 定义矩阵的行列数，例如： x - 1:12 dim(x) - c(3,4) ,1 ,2 ,3 ,4 1, 1 4 7 10 2, 2 5 8 11 3, 3 6 9 12 matrix.x - matrix(1:12,nrow=3,byrow=T)t(x)#转置 为行或列添加名称：row.names() col.names()3.数据框