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姓名: 学号: 专业: 高斯计算分子的基本流程:(1) 利用高斯View建立一个分子模型,保存为gif格式。(2) 用高斯03对该分子进行几何优化、单点能计算和频率计算。 几何优化:用高斯03调用已经建好的甲烷模型(格式为gif),用#T RHF/6-31G(d) Opt Test命令对其进行优化。其中分子电荷和自旋多重度分别设定为0、1。优化前分子输入的坐标为: Standard orientation: - Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms) Number Number Type X Y Z - 1 6 0 0.000000 0.000000 0.000000 2 1 0 0.617765 0.617765 0.617765 3 1 0 -0.617765 -0.617765 0.617765 4 1 0 -0.617765 0.617765 -0.617765 5 1 0 0.617765 -0.617765 -0.617765-优化后分子的输出坐标为: Standard orientation: - Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms) Number Number Type X Y Z - 1 6 0 0.000000 0.000000 0.000000 2 1 0 0.625213 0.625213 0.625213 3 1 0 -0.625213 -0.625213 0.625213 4 1 0 -0.625213 0.625213 -0.625213 5 1 0 0.625213 -0.625213 -0.625213-优化后分子中各原子电荷Mulliken分布:Mulliken atomic charges: 1 1 C -0.793976 2 H 0.198494 3 H 0.198494 4 H 0.198494 5 H 0.198494 Sum of Mulliken charges= 0.00000优化后分子的偶极矩:Dipole moment (field-independent basis, Debye):X= 0.0000 Y= 0.0000 Z= 0.0000 Tot= 0.0000优化后分子Z矩阵的最终结构:其中B为键长,A为两个键形成的键角,D为二面角。以此类推,可以查处分子中各原子的键长,键角,二面角等信息。Final structure in terms of initial Z-matrix: C H,1,B1 H,1,B2,2,A1 H,1,B3,3,A2,2,D1,0 H,1,B4,3,A3,2,D2,0 Variables: B1=1.08290142 B2=1.08290142 B3=1.08290142 B4=1.08290142 A1=109.47122063 A2=109.47122063 A3=109.47122063 D1=-120. D2=120. 振动频率的计算:在高斯03中,仍调用自己新建的分子模型,用命令#T RHF/6-31G(d) Freq Test对优化后的分子进行振动频率的计算。其中设定分子电荷和自旋多重度分别为0、1。对原模型分子的结构信息进行修改,在Molecule Specification栏中将原来的坐标信息全部删除,输入优化后分子的坐标信息:输入的坐标为: Standard orientation: - Center Atomic Atomic Coordinates (Angstroms) Number Number Type X Y Z - 1 6 0 0.000000 0.000000 0.000000 2 1 0 0.625213 0.625213 0.625213 3 1 0 -0.625213 -0.625213 0.625213 4 1 0 -0.625213 0.625213 -0.625213 5 1 0 0.625213 -0.625213 -0.625213 -用该算法可以得到以下信息,这些信息包括电子空间范围,偶极矩,四极矩,八极矩,十六极矩,以及分子的对称等信息:Electronic spatial extent (au): = 35.4787 Charge= 0.0000 electrons Dipole moment (field-independent basis, Debye): X= 0.0000 Y= 0.0000 Z= 0.0000 Tot= 0.0000 Quadrupole moment (field-independent basis, Debye-Ang): XX= -8.3966 YY= -8.3966 ZZ= -8.3966 XY= 0.0000 XZ= 0.0000 YZ= 0.0000 Traceless Quadrupole moment (field-independent basis, Debye-Ang): XX= 0.0000 YY= 0.0000 ZZ= 0.0000 XY= 0.0000 XZ= 0.0000 YZ= 0.0000 Octapole moment (field-independent basis, Debye-Ang*2): XXX= 0.0000 YYY= 0.0000 ZZZ= 0.0000 XYY= 0.0000 XXY= 0.0000 XXZ= 0.0000 XZZ= 0.0000 YZZ= 0.0000 YYZ= 0.0000 XYZ= 0.7204 Hexadecapole moment (field-independent basis, Debye-Ang*3): XXXX= -15.3377 YYYY= -15.3377 ZZZZ= -15.3377 XXXY= 0.0000 XXXZ= 0.0000 YYYX= 0.0000 YYYZ= 0.0000 ZZZX= 0.0000 ZZZY= 0.0000 XXYY= -4.6685 XXZZ= -4.6685 YYZZ= -4.6685 XXYZ= 0.0000 YYXZ= 0.0000 ZZXY= 0.0000 N-N= 1.352346022364D+01 E-N=-1.194388681302D+02 KE= 3.9887902
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