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木薯等大戟科植物耐寒抗旱相关miRNA的分离与鉴定microRNA(miRNA)是一类21nt的,在转录后水平上调节mRNA的非编码RNA。 miRNA的调控作用涉及几乎所有重要的生物学过程。为了解miRNA在重要显花植物家族大戟科中的作用,本研究运用计算预测和 实验分析相结合的方法,克服了多数大戟科物种缺乏基因组信息的问题,开展了 在基因组水平上的大规模发掘和分析大戟科miRNA功能的系统研究。本研究利用 已经释放的蓖麻基因组序列信息在蓖麻中预测了 23个miRNA家族的85个miRNA, 随后利用蓖麻(Ricinus communis),木薯(Manihot esculenta),橡胶树(Hevea brasiliensis)和麻风树(Jatropha curcas)这4个物种的苗期样品对这85个 miRNA进行差异表达分析,发现其中58个miRNA(占85 miRNA的68.2%)至少在4 个大戟科物种之一中表达,进一步研究发现48个miRNA(85 miRNA的56.5%)在低 温和干旱胁迫条件下,以及在胁迫后的回复过程中有明显表达。以上研究结果表明miRNA具有物种和环境特异性的表达模式。另外,本研究 利用Hitsensor软件,预测出63个miRNA与83个靶基因之间的258对互作,并对 其中10个互作对进行了验证,证实了其中的6个互作对,并确定了靶基因的剪切 位点。本研究是第一次在大戟科植物中收集miRNA及其靶基因,这些研究成果为今 后在大戟科植物家族中研究生物和非生物胁迫奠定了基础。
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