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资源描述
高性能计算(HPC)高性能计算(HPC)概念指使用多处理器(作为单个机器的一部分)或者某一集群中 组织的几台计算机(作为单个计算资源操作)的计算系统和 环境。单指令(SIMD):跨多个处理器的同 一-时执行相同的计算指令和操作,理解计算分类I为计算单一任务 多指令(MIMD):跨多个处理器的同 一时执行相同的计算指令和操作,理解为讣算多任务消息传递接口(MPI):节点间传递计算消息函数库:提供计算过程中所必须的解释工具高性能计算(HPC)机组成 2、计算子系统(可包含CPU、GPU、多路子节点) 2、网络子系统(管理网络;计算网络 (Ethernet、IB) 3、存储子系统(本地存储、并行存储) 4、管理子系统(对整个高性能计算平台运行性能进行实时 监控和管理功能,同时还实现用户交互接口,用户可以方便地登录到 高性能计算平台申请功能服务器及硬件资源,启动、停止自己功能 服务器功能。) 5、软件子系统(系统软件包括操作系统、編程语言、并行环境、 数学库.性能调优工具、管理软件、调度软件)咼性能计算设备拓扑管理节点存储阵列以太网 Infiniband 光纤网-KVMIJ交换机i 速Infiniband 交换机控制台木地KVM千兴交换机;Internet 1、熟悉HPC的核心a) CPU (basic、standard advaneed)b) 熟悉Unpack的算法c) 两代主流CPU直接的比较d) 熟悉内存和硬盘及Raid技术e) 了解用户计算软件应用情况f) 了解用户计算网络环境需求 2、了解我们能为用户做什么a) 机群硬件系统搭建b) 机群软件系统安装Unpack理论峰值计算 什么是Unpack?是国际上主流测试HPC浮点运算能力的工具,影响其数值要素为;硬件、 软件及执行参数。硕件:CPU、内存、网络软件主要指:MPI、数学库(函数库)执行参数指:矩阵规模(计算元N次方程矩阵,采用高斯消元法(就是 我们说的代入法),通常有200. 1000. N即自定义三种。)理论浮点邮值二CPU主频XCPU每个II寸钟周期执行浮点运算的次数x系统中CPU核心数冃所以理论值和实际值是有差距的,目前要求Unpack的人在逐渐减少 Raid技术a) Raid 0b) Raid 1c) Raid 5计算网络a) 千兆网络b) Infiniband高速计算网络如何做好HPC的销售工作之应用 篇1、计算物理主要应用软件:VASP了解用户研究方向:物理计算方向有金属、半导体、绝缘体 了解关键词:Kpoint 4X4X4 8X8X8CPU选型:advanced内存选型:1、根据CPU2、CPU及Kpoint硬盘选型:I/O量小,SATA网络选型:跟进Kpoint软件线性比:高如何做好HPC的销售工作之应用3、计算数学主要应用软件:Gaussian了解用户研究方向:科研基础软件 了解关键词:需要CPU高主频,并行效果差CPU选型:advanced内存选型:1、根据CPU2、不需要大内存硬盘选型:I/O量大,SAS网络选型:不建议跨节点,需跨节点选择IB 9如何做好HPC的销售工作之应用篇4、流体力学/分子动力学主要应用软件:CFD(Ansys Fluent)工程计算 软件了解用户研究方向:流体材料、空气动力、 化学反应了解关键词:并行效果高,动态负载均衡CPU选型:advanced内存选型:1、根据CPU2、需要大内存如何做好HPC的销售工作之应用5、量子化学主要应用软件:ADF了解用户研究方向:物理光谱、分子计算、 材米脇算了解关键词:并行效果高,动态负载均衡CPU选型:advanced内存选型:1、根据CPU2、不需要大内存硬盘选型:I/O量小,SATA如何做好HPC的销售工作之应用篇6、材料计算主要应用软件:wien2k了解用户研究方向:材料计算、电导率了解关键词:并行效果低CPU选型:advanced内存选型:1、根据CPU2、需要大内存硬盘选型:I/O量大,SAS网络选型:千兆网12如何做好HPC的销售工作之应用篇6、理论化学计算主要应用软件:NAMD+CHARMM;GROMACS;AMBER了解用户研究方向:理论化学研究;材料计 算;分子动力学了解关键词:并行效果高CPU选型:advanced内存选型:1根据CPU应用方向:1、生命科学2、自制程序GPGPU硬件产品编程环境应用情况厂商Tesla 系列GPGPUCUDA应用软件的 较为广范的 支持14如何做好HPC的销售工作之GPU应用支持GPGPU的生物计算软件一GROMACS支持GPGPU的生物计算软件一NAMD支持GPGPU的生物计算软件一HMMER支持GPGPU的生物计算软件一MUMmerGPU支持GPGPU的生物计算软件一AxRecon
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