用用EpiData快速建立快速建立数据管理程序数据管理程序南京军区南京总医院信息科 刘玉秀liu_yuxiu163.com2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序主要内容主要内容 EpiData基本情况基本情况 数据管理过程数据管理过程-原理上原理上 EpiData使用流程使用流程-建立调查表及数据文件生成建立调查表及数据文件生成-添加字段控制添加字段控制-输入数据和产生数据文件资料输入数据和产生数据文件资料-数据文件修改和数据转出数据文件修改和数据转出-选项设置和程序参数选项设置和程序参数2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序EpiData基本情况基本情况 选选择择合合适适的的数数据据管管理理软软件件是是保保证证数数据据质量的重要方面质量的重要方面 参参照照EpiInfo 6.0免免费费软软件件,丹丹麦麦学学者者Lauritsen JM等等人人1999年年发发起起, Bruus M编写程序而完成编写程序而完成,目前为目前为3.0版版,免费使用免费使用 可可在在Windows 95/98/NT/2000/XP环环境境下使用下使用 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序EpiData基本情况基本情况 能能快快速速建建立立数数据据录录入入程程序序，可可满满足足数数据的校验录入、双份比较据的校验录入、双份比较 建建立立的的数数据据库库可可转转变变成成dBase、Excel文文件件以以及及SAS、SPSS和和Stata统统计计分分析析软软件的数据格式件的数据格式 为为数数据据管管理理软软件件，暂暂不不具具有有统统计计分分析析功能，适于单表，也适于含子表的情形功能，适于单表，也适于含子表的情形2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序EpiData基本情况基本情况 EpiData秉秉承承EpiInfo DOS版版本本的的简简便便性，性，EpiInfo在世界上已拥有众多用户在世界上已拥有众多用户 简简便便性性体体现现：以以文文本本形形式式编编写写文文件件，通通过过程程序序将将此此文文本本文文件件转转换换成成数数据据输输入入表格表格 安安装装时时不不受受计计算算机机设设置置的的影影响响。无无需需安装或替换任何的安装或替换任何的DLL文件或系统文件文件或系统文件 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序EpiData基本情况基本情况 局限性局限性1：是单用户程序，无网络版：是单用户程序，无网络版 局限性局限性2：记录数限制：记录数限制20万条左右万条左右 局限性局限性3：字段数限制：字段数限制999行内写完行内写完 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序EpiData基本情况基本情况总结总结 EpiData是是用用于于数数据据输输入入和和数数据据存存档档的一套程序的一套程序 EpiData不不是是用用来来进进行行分分析析的的，进进行行统计分析有其他专用的软件可以利用统计分析有其他专用的软件可以利用 基基本本设设计计思思想想是是帮帮助助用用户户生生成成较较好好的的原始数据供以后分析使用原始数据供以后分析使用 有一定的局限性有一定的局限性2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序EpiData程序可用于程序可用于 定义数据结构；定义数据结构； 简化数据输入；简化数据输入； 应用校验原理进行数据录入；应用校验原理进行数据录入； 编辑编辑/纠正已经录入的数据；纠正已经录入的数据； 确认变量间的一致性、逻辑性；确认变量间的一致性、逻辑性； 显示或打印数据核查错误结果留存；显示或打印数据核查错误结果留存； 双份录入数据的比较；双份录入数据的比较； 导出数据供统计分析使用。导出数据供统计分析使用。2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序EpiData的三种文件类型的三种文件类型 QES文文件件(调调查查表表文文件件)：定定义义调调查查表表（问卷）的结构（问卷）的结构 ； REC文文件件(数数据据文文件件)：存存放放数数据据以以及及已经定义好的编码；已经定义好的编码； CHK文文件件(核核查查文文件件)：定定义义了了数数据据输输入时字段的有效性规则。入时字段的有效性规则。2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序确立研究的目的确立研究的目的 描述假定，研究例数，时间安排，描述假定，研究例数，时间安排， 资助的保障，资助的保障，2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序数据质量的技术保证数据质量的技术保证 应用合法值、限定范围等方法应用合法值、限定范围等方法 对对所所有有或或者者部部分分数数据据进进行行两两次次输输入入以以发发现键盘打字错误现键盘打字错误 发现错误并纠正错误发现错误并纠正错误 应建立错误列表及错误纠正的文件记录2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序数据一致性、逻辑性数据一致性、逻辑性 是否符合常理。例如外祖母不到是否符合常理。例如外祖母不到35岁岁 缺失数据数量。有时不得已，注意影响缺失数据数量。有时不得已，注意影响 决定有效例数决定有效例数 以文件形式记录有关决定2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序准备分析数据集准备分析数据集 数据清理数据清理 新变量的生成和转换新变量的生成和转换 有关决定应留有文件记录2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序数据备份，档案保存数据备份，档案保存 数据复制备份，建立档案，安全保存数据复制备份，建立档案，安全保存-所所有有项项目目计计划划、表表格格、调调查查表表、错错误误清清单单以以及及其其它它文文件件都都应应有有复复制制件件，原原始始的的调调查查表表和和作作为为证明等用的其它材料均应留档保存一定时间证明等用的其它材料均应留档保存一定时间 目目的的是是能能从从最最后后的的数数据据库库中中追追查查到到原原始始观察对象每一变量的每一个数值观察对象每一变量的每一个数值 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序数据分析数据分析 原则上所有的分析均应能重复出来原则上所有的分析均应能重复出来与分析有关的所有资料也应作为研究文件保留2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序某某临临床床研研究究单单位位的的数数据据管管理理数据库设计数据库设计 病例记录表病例记录表 电子记录表电子记录表( (数据输入程序数据输入程序) )数据收集指南数据收集指南数据输入数据输入 ( (两次输入两次输入: :输入与核对输入与核对) )编码编码( (医药名词医药名词) )数据清理数据清理 数据库说明数据库说明 建立范围检查和逻辑检查建立范围检查和逻辑检查 生成问题表和医生的答复生成问题表和医生的答复数据最终清理和数据锁定数据最终清理和数据锁定统计分析统计分析统计报告统计报告2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序FDA对用于临床试验计算机数据管理的要求对用于临床试验计算机数据管理的要求p 系统设计应符合研究设计的要求（如单位、加盲），排除数系统设计应符合研究设计的要求（如单位、加盲），排除数 据创建、修改、维持、存档、恢复或传送中的错误；据创建、修改、维持、存档、恢复或传送中的错误；p 确定并记录采用什么软件和硬件来实现上述目的；确定并记录采用什么软件和硬件来实现上述目的； p 保留原始文件保留原始文件, 以备必要时重建系统；以备必要时重建系统；p 符合临床试验中保存和保留记录的适用管理要求，与文字记符合临床试验中保存和保留记录的适用管理要求，与文字记 录同样可信。录同样可信。 p 对记录的改动应保持原先的信息清晰可见。记录应清楚显示对记录的改动应保持原先的信息清晰可见。记录应清楚显示 所作的改变，并提供一种可定位和阅读先前资料的方法。所作的改变，并提供一种可定位和阅读先前资料的方法。p 改变数据应保留稽查轨迹：该文件能提供是谁，在什么时候，改变数据应保留稽查轨迹：该文件能提供是谁，在什么时候， 为什么作了这一改变。以保护真实性、完整性和机密性。为什么作了这一改变。以保护真实性、完整性和机密性。p 从数据中应当可以获取研究中每一例对象的全部资料。从数据中应当可以获取研究中每一例对象的全部资料。p 能防止未经授权者访问数据和计算机系统。能防止未经授权者访问数据和计算机系统。2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序EpiData使用流程图使用流程图 进入进入2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序建立调查表建立调查表 建建立立数数据据定定义义是是一一基基础础性性工工作作，也也是关键性的工作是关键性的工作 在在EpiData表现为建成表现为建成QES文件文件2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序QES文件字段定义文件字段定义字符型：用下划线字符型：用下划线数字型：用数字型：用#号，每位一号，每位一#，#.#逻辑型：用逻辑型：用Y或或N,、日期型：日期型： 字段名框在字段名框在 之中之中2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序id (automatic id number) V1 Sex #V2 Heighy (meter) #.#V3 Weight (kilo) #.#bmi Body Mass Index #.#V4 Date of birth V5 Age today #V6 Country of Residnece _QES文件字段定义文件字段定义举例举例2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序生成字段名设置选项生成字段名设置选项2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序生成字段名生成字段名-几条规则几条规则 文本中优先选择用花括号括进的文本文本中优先选择用花括号括进的文本 通用常见单词不作为字段名组成部分通用常见单词不作为字段名组成部分 字字段段前前为为空空，字字段段名名就就取取前前一一个个字字段段名名再再加加上上一一个个数数字字。如如果果不不存存在在前前一一个个字段名则使用隐含字段名字段名则使用隐含字段名FIELD1 首字符为数字，则在首字符前插首字符为数字，则在首字符前插N 大大小小写写取取决决于于“文文件件”菜菜单单中中“选选项项” 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序- 问题 产生的字段名 使用规则-State your nationality NATION Rule 1All you like is icecream LICE Rule 1What is your name ISYOURNA Rule 23.question: N3QUESTI Rule 4-经验：实际工作中，对以中文为语言的调查表，经验：实际工作中，对以中文为语言的调查表，最好用花括号直接指定英文字段名。最好用花括号直接指定英文字段名。 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序变量标记变量标记 又又称称变变量量标标签签（variable label）是是对对字段内容的一种描述或说明，自动生成字段内容的一种描述或说明，自动生成 设设置置“以以调调查查表表第第一一个个词词命命名名” ：例例如如v1 Age of patient #，“v1”为为字字段段名，名，“Age of patient”为变量标记为变量标记 设设 置置 “自自 动动 添添 加加 字字 段段 名名 ”： v1ageofp为为字字段段名名，变变量量标标记记v1 Age of patient 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序变量标记变量标记 随随数数据据一一并并导导出出到到文文件件中中。对对SAS，则则生生成成源源代代码码。因因系系自自动动生生成成，导导出出的的变变量量标标记记常常常常不不另另人人满满意意，这这时时需需要要费费点点功功夫夫到到SAS数数据据集集处处理理的的源源程程序序代代码码中修改。中修改。2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序数据文件生成数据文件生成 在在EpiData表现为生成表现为生成REC文件文件 本文件基于本文件基于QES文件而生成文件而生成 产生产生REC文件前可提问输入文件标记文件前可提问输入文件标记 警惕警惕：覆盖文件操作一定要慎重：覆盖文件操作一定要慎重2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序添加字段控制添加字段控制 本本步步骤骤可可以以使使数数据据输输入入过过程程按按给给定定的的一一些些规规则则和和算算法法完完成成，这这是是EpiData功功能能的最强大体现的最强大体现 添添加加输输入入控控制制的的指指令令以以文文件件形形式式单单独独保存，该文件后缀为保存，该文件后缀为CHK 程程序序运运行行时时，自自动动寻寻找找与与扩扩展展名名REC相同文件的相同文件的CHK文件文件 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序添加字段控制添加字段控制 限制特定数值的输入限制特定数值的输入 给出输入的数值编码的文字描述给出输入的数值编码的文字描述 指定数据输入的顺序指定数据输入的顺序 数据输入时自动计算数据输入时自动计算 可可在在输输入入数数据据时时添添加加显显示示帮帮助助信信息息和和其他有关的提示等其他有关的提示等 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序添加字段控制添加字段控制5项基本功项基本功 标签：给出各数字对应的描述性文本标签：给出各数字对应的描述性文本 限定特定值（数值范围，合法值）限定特定值（数值范围，合法值） 指定输入的顺序（跳转）指定输入的顺序（跳转） 某些字段不得缺项，必须输入某些字段不得缺项，必须输入 重复上一条记录的某字段值重复上一条记录的某字段值 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序添加字段控制添加字段控制1项高级功项高级功 相当于在相当于在CHK文件中进行编程文件中进行编程 需掌握各种需掌握各种check commands：-ifthenendif、mustenter、relate 需熟悉各种需熟悉各种operators和和functions：-arithmetic、string、date、time2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序输入数据输入数据 选选中中“输输入入数数据据”，给给定定数数据据文文件件，即显示数据录入界面即显示数据录入界面注意事项注意事项 无键入内容，仅按回车，以缺失值论无键入内容，仅按回车，以缺失值论 字段填满，光标自动跳到下一个字段字段填满，光标自动跳到下一个字段 任何时候要退出录入，按任何时候要退出录入，按F10键即可键即可 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序双份录入和对比核查双份录入和对比核查 两两位位录录入入员员将将同同样样的的调调查查表表输输入入到到两两份数据文件中份数据文件中 “对两个数据文件进行有效性检查对两个数据文件进行有效性检查” 原理原理-两两个个录录入入员员在在同同样样的的字字段段犯犯同同样样输输入入错错误误的的概概率率很很小小，一一旦旦发发现现输输入入不一致，则必然有一位出错不一致，则必然有一位出错 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序产生数据文件资料产生数据文件资料 基基本本信信息息：数数据据文文件件信信息息包包括括数数据据文文件件名名、文文件件大大小小、最最后后一一次次更更新新日日期期、字字段段数数、记记录录数数、是是否否使使用用核核查查功功能能。对对于于文文件件中中的的每每个个输输入入字字段段，给给出出的的信信息息包包括括输输入入字字段段名名、字字段段的的变变量量标标记记、字字段段类类型型、字字段段的的宽宽度度、所所使使用用的的核核查查项清单、数值标签项清单、数值标签 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序产生数据文件资料产生数据文件资料 编编码码册册(codebook)：给给出出数数据据文文件件中中的的关关键键字字段段及及对对数数据据的的基基本本描描述述，包包括括记记录录数数，作作了了删删除除记记录录的的记记录录数数。对对数数据据文文件件的的每每一一个个变变量量显显示示变变量量标标记记、字字段段类类型型、核核查查条条件件及及缺缺失失值值记记录录数数，对对于于数数字字字字段段将将显显示示数数值值范范围围、均均值值、标标准差或频数表，这取决于字段类型准差或频数表，这取决于字段类型 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序产生数据文件资料产生数据文件资料 显显示示数数据据：可可以以有有选选择择打打印印出出所所有有记记录的全部或部分内容。录的全部或部分内容。-按按“全全选选”则则选选择择所所有有字字段段，按按“不不选选”则则全部字段均不选全部字段均不选 -控控制制列列清清单单的的尺尺寸寸：可可以以改改变变列列清清单单的的宽宽度度以以保保证证有有较较清清晰晰的的输输出出。可可以以改改变变行行宽宽或或列列数数。注注意意，如如数数据据实实际际宽宽度度比比数数据据列列宽宽，数数据据将将被被截截取取(出现出现-)。 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序数据文件修改数据文件修改 对对一一个个已已经经包包含含数数据据的的数数据据文文件件可可以以进行修改。进行修改。 可可以以增增加加字字段段，改改变变字字段段的的定定义义或或删删除字段除字段 注注意意：如如果果删删除除字字段段或或改改变变字字段段名名，数据会丢失！数据会丢失！ 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序数据导出数据导出 EpiData软软 件件 产产 生生 的的 数数 据据 文文 件件 以以“REC”作作为为扩扩展展名名，一一般般不不能能被被其其它它软软件程序所调用件程序所调用 数据备份数据备份 转出为文本文件转出为文本文件 数据转成数据转成dBase III格式格式 数据转成数据转成Excel格式格式 转出成转出成Stata、SPSS、SAS所用的数据所用的数据 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序选项设置选项设置 通通过过选选择择“文文件件”的的“选选项项”进进行行设设定定。注注意意在在选选项项中中的的改改变变只只有有在在关关闭闭EpiData才才被被存存入入硬硬盘盘。通通过过“选选项项”设设置，可使界面设计得更美观、漂亮置，可使界面设计得更美观、漂亮 编辑器选项编辑器选项 显示数据表选项显示数据表选项 产生数据文件选项产生数据文件选项 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序程序运行参数程序运行参数 参参数数可可在在批批处处理理文文件件中中指指定定或或使使用用 Windows Link文件文件 /NOTOOLBARS：隐藏两个工具条隐藏两个工具条 /AUTOSAVE：省省去去“是是否否存存盘盘?”消消息息 /CONFIRM：抑抑制制当当一一个个字字段段添添满满后后自动转向下一个字段的功能自动转向下一个字段的功能 上上述述的的参参数数设设置置可可用用于于建建立立桌桌面面上上快快捷方式的数据输入程序捷方式的数据输入程序 2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序2003-11-16EpiData快速建立数据管理程序