基因流动物例子 狗是第一个被驯化的动物，可能起源于与人类发生了密切接触的灰狼。不过，狗的起源仍有很多争议。虽然已经有不少这方面的研究，但绝大部分研究是基于现代的狗和灰狼进行溯祖，有些问题依旧未能解决。 化石 DNA 是研究起源问题非常好的材料。不过，众所周知，在古代化石中测出全基因组序列是一件很困难的事情。以前只有 6 个化石样本的全基因组序列被发表出来，而这样的样本量对群体历史研究来说远远不够。 这项研究对来自世界各地的 27 只古代狗化石进行了全基因组测序，用古代狗的基因组跟现代狗比较。古代化石 DNA 的样本数量上有了飞跃。 化石采集地和历史 为了研究古代和现代狗的群体结构，这项研究对 f4-tatitic 矩阵进行 PCA。F4-tatitic 用来衡量衡量不同群体间的基因漂变（genetic drift），具体计算可以参考 Admiture, Population Structure, and F-Statitic 这篇文章（doi: 10。1534、genetic。115、183913）。PC 1 将欧亚大陆的东西部狗划分出来，而 PC 2 将南北方向的狗划分出来（欧洲到非洲）。 f4-tatitic PCA 揭示群体结构 祖先群体的混合图和年代推断 在检测基因流的时候发现，狗与灰狼间的基因流很大程度上是单向传播的，并不是之前认为的双向流动。结果也显示，狗并不存在多个起源种群。所有的狗都来自一个古老的、现已灭绝的灰狼种群。除了起源种群外，狼到狗的基因流非常有限。 狗的群体历史还可以用来追踪人的群体历史比较，揭示人类的群体迁徙事件。不过，狗与人类的群体历史有时并不一致，可能是狗被作为贸易商品导致的。 狗与人类的迁徙 对细节感兴趣的话可看看这篇文章。附上文章链接：