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真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。第七章 线粒体DNA多态性真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。学习目的1 了解mtDNA的结构与功能 、线粒体基因组; 2 掌握mtDNA多态性 、mtDNA单核苷酸多态性 、 mtDNA的串联重复序列多态性 、mtDNA单倍群; 3 了解mtDNA分型命名 、 mtDNA分析技术 (法医mtDNA分型 、人类线粒体全基因组DNA分析 );4 掌握mtDNA分型的特殊问题 。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。生物的遗传生物的遗传DNADNA的分布的分布主要在染色体上主要在染色体上细胞质内细胞质内细胞核遗传细胞核遗传细胞质遗传细胞质遗传(所以说,染(所以说,染色体是色体是DNADNA的主的主要载体)要载体)97.5%97.5%2.5%真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。前言线粒体电镜照片线粒体电镜照片真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。线粒体线粒体“能量工厂能量工厂” 光镜下线粒体外型多样,一般为颗粒状,电镜下的主要特征是双层膜且有嵴。线粒体中分布着三羧酸循环系统和电子传递系统,是细胞氧化磷酸化反应产生ATP的场所。此外,线粒体是核外唯一含有遗传效应物质的细胞器。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 线粒体是真核细胞内的重要细胞器,它是细胞的能量工厂,细胞产生能量的95 %来自线粒体中进行的氧化磷酸化。除了红细胞外,人类所有体细胞都含有线粒体,其中多数细胞含有数以万计的线粒体。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 通常把所有细胞器和细胞质颗粒中的通常把所有细胞器和细胞质颗粒中的遗传物质,统称为遗传物质,统称为细胞质基因组细胞质基因组。把细胞。把细胞质基因所决定的遗传现象和遗传规律称为质基因所决定的遗传现象和遗传规律称为细胞质遗传细胞质遗传。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。细胞器和细胞质颗粒中的遗传物质,统称为细胞质基因组(plasmon)。 真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。由由由由于于于于缺缺缺缺乏乏乏乏组组组组蛋蛋蛋蛋白白白白的的的的保保保保护护护护,线线线线粒粒粒粒体体体体亦亦亦亦缺缺缺缺乏乏乏乏DNADNA损损损损伤伤伤伤修复系统,修复系统,修复系统,修复系统,mtDNAmtDNA的突变率较高。的突变率较高。的突变率较高。的突变率较高。一一一一、mtDNAmtDNA的结构特征的结构特征的结构特征的结构特征线线线线粒粒粒粒体体体体是是是是细细细细胞胞胞胞质质质质中中中中独独独独立立立立的的的的细细细细胞胞胞胞器器器器,也也也也是是是是动动动动物物物物细细细细胞胞胞胞核外唯一的含有核外唯一的含有核外唯一的含有核外唯一的含有DNADNA的细胞器。的细胞器。的细胞器。的细胞器。19811981年年年年,剑剑剑剑桥桥桥桥大大大大学学学学的的的的AndersonAnderson小小小小组组组组测测测测定定定定了了了了人人人人mtDNAmtDNA的完整的完整的完整的完整DNADNA序列,称为序列,称为序列,称为序列,称为“ “剑桥序列剑桥序列剑桥序列剑桥序列” ”。第一节第一节 mtDNA的结构和功能的结构和功能真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。人人人人mtDNAmtDNA是是是是一一一一个个个个长长长长为为为为16,569 16,569 bpbp的的的的双双双双链链链链闭闭闭闭合合合合环环环环状状状状分分分分子子子子,外外外外环环环环含含含含GG较较较较多多多多,称称称称重重重重链链链链(H(H链链链链) ),内内内内环环环环含含含含C C较较较较多多多多,称称称称轻轻轻轻链链链链(L(L链链链链) )。 mtDNAmtDNA双双双双链链链链闭闭闭闭合合合合环环环环状状状状在在在在降降降降解解解解检检检检材材材材中中中中不不不不易易易易被被被被核核核核酸酸酸酸外外外外切切切切酶酶酶酶影响,在法医检材中能保持影响,在法医检材中能保持影响,在法医检材中能保持影响,在法医检材中能保持mtDNAmtDNA完整性。完整性。完整性。完整性。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。线粒体线粒体DNADNA惟一的细胞核外惟一的细胞核外DNADNA,携带有编码蛋白质和,携带有编码蛋白质和RNARNA的基因的基因结构:结构:双链双链16569bp,其中一条为重连,一条其中一条为重连,一条为轻连。基因编码物为轻连。基因编码物各不相同。各不相同。基因中不含非编码序列,基因中不含非编码序列,多数情况下,几乎不多数情况下,几乎不含终止密码。含终止密码。转录与翻译均在线粒体中进行。转录与翻译均在线粒体中进行。DNA不与组蛋白结合不与组蛋白结合部分密码子不同于核基部分密码子不同于核基因组密码子。因组密码子。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。特征特征(1 1)碱基)碱基结构紧凑、简洁:结构紧凑、简洁:以最少碱基数编码尽量以最少碱基数编码尽量多的蛋白质和多的蛋白质和RNARNA 基因间无间隔序列基因间无间隔序列 基因内无内含子、前导序列、带帽序列和终基因内无内含子、前导序列、带帽序列和终止信号止信号 相邻基因甚至有碱基的重叠相邻基因甚至有碱基的重叠 (2 2)不存在同源基因间的重组与交换)不存在同源基因间的重组与交换 结果:结果:mtDNAmtDNA所有序列变异呈单倍型特性所有序列变异呈单倍型特性 精细胞精细胞卵细胞卵细胞真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 遗传密码与一般的通用密码不同遗传密码与一般的通用密码不同密码子密码子 核核DNA mtDNA UGA 终止终止 色氨酸色氨酸 AGA, AGG 精氨酸精氨酸 终止终止 AAA 赖氨酸赖氨酸 天冬酰胺天冬酰胺 AUA 异亮氨酸异亮氨酸 蛋氨酸蛋氨酸 甲硫酰胺甲硫酰胺 AUG AUA起始甲硫酰胺起始甲硫酰胺 AUG AUGAUAAUUAUC真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。功能:功能:储存信息储存信息-编码参与氧化磷酸化蛋白质和编码参与氧化磷酸化蛋白质和RNARNA的基因的基因 H H 链:链:2 2个个rRNArRNA,1414个个tRNAtRNA,1212个蛋白质个蛋白质 L L 链:链:8 8个个rRNArRNA,1 1个蛋白质个蛋白质 自身复制自身复制-单向复制单向复制: :置换环复制或置换环复制或D-D-环环(D-loop)(D-loop)复制复制 特点:特点:不对称的复制,不对称的复制, H H链和链和L L链各有一个复制起点,先复制链各有一个复制起点,先复制H H链,链, H H链复制到达链复制到达L L链起始点后,链起始点后,L L链开始复制链开始复制 D- D-环:环:新合成第三条新合成第三条H H链姊妹链链姊妹链 ,序列与,序列与L L链互补链互补 H H链复制起点附近(链复制起点附近( 520-700 520-700 ),高变异),高变异 转录功能转录功能-两条链同时转录合成两条链同时转录合成RNA-RNA-对称转录对称转录 真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。mtDNAmtDNA与核常染色体与核常染色体DNADNA的比较的比较mtDNA核常染色体DNA结构闭合、环状子,无组蛋白线状,形成核小体大小大小为16,569bp约30亿bp数目50几千个拷贝 /细胞1个拷贝 /细胞编码约有1,100bp非编码区基因组大部分为非编码区遗传方式母系遗传孟德尔方式遗传重组不发生重组,单倍型遗传发生重组突变率高低全序列获得1981年, Aderson序列(剑桥序列)2001年草图真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。二、二、二、二、mtDNAmtDNA的遗传学特征的遗传学特征的遗传学特征的遗传学特征1. 1. mtDNAmtDNA为为为为母系遗传母系遗传母系遗传母系遗传2 2 mtDNAmtDNA高拷贝和异质性高拷贝和异质性高拷贝和异质性高拷贝和异质性 3 3 mtDNAmtDNA复制分离复制分离复制分离复制分离和瓶颈效应和瓶颈效应和瓶颈效应和瓶颈效应4. 4. mtDNAmtDNA的的的的阈值效应阈值效应阈值效应阈值效应1.5 半自主的细胞器半自主的细胞器二二 mtDNA真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 母系遗传母系遗传 线粒体基因组的遗传表现出典型的母系遗传线粒体基因组的遗传表现出典型的母系遗传的特点:只有女性患者可将致病基因传递给后代,的特点:只有女性患者可将致病基因传递给后代,而后代无论男女均可发病。精子的线粒体外膜上存而后代无论男女均可发病。精子的线粒体外膜上存在有泛素,当精子进入卵子后,受精卵以一种主动在有泛素,当精子进入卵子后,受精卵以一种主动的方式降解了来自精子的线粒体及其中的的方式降解了来自精子的线粒体及其中的DNADNA。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。高拷贝和异质性高拷贝和异质性 mtDNAmtDNA在一个细胞中具有数百次拷贝,因此在一个细胞中具有数百次拷贝,因此mtDNA突变比例可以在突变比例可以在0到到100%之间变化,之间变化,异质性异质性:一两个不同的mtDNA序列存在于一个个体的细胞、组织和不同的个体时。 真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 阈值效应(threshold effects) 对于异质性的mtDNA突变,细胞可以承受正常的mtDNA减少直到一个阈值时细胞才调亡或细胞的功能受损。 mtDNA突变所产生的效应取决于该细胞中野生型和突变型线粒体DNA的比例,只有突变型DNA达到一定数量(阈值)才足以引起细胞的功能障碍,这种现象称为阈值效应。 阈值效应的一个表现就是在某些线粒体遗传病的家系中,有些个体起初并没有临床症状,但随年龄增加由于自发突变、环境选择等原因,突变型DNA逐渐积累,线粒体的能量代谢功能持续性下降,最终出现临床症状。 mtDNA mtDNA突变可以影响线粒体功能,引起突变可以影响线粒体功能,引起ATPATP合成障碍,合成障碍,导致疾病发生,但实际上基因型和表现型的关系并非导致疾病发生,但实际上基因型和表现型的关系并非如此简单。突变型如此简单。突变型mtDNAmtDNA的表达受细胞中线粒体的异的表达受细胞中线粒体的异质性水平以及组织器官维持正常功能所需的最低能量质性水平以及组织器官维持正常功能所需的最低能量影响,可产生不同的外显率和表现度。影响,可产生不同的外显率和表现度。 真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。瓶颈效应: 卵细胞中有100000左右拷贝的mtDNA,在受精卵形成时,只有数个拷贝卵细胞的mtDNA进入到受精卵,这个现象称为瓶颈效应。因此异质性的母亲的孩子通常会有平均水平不同的异质性突变。可以解释在一些线粒体遗传病具有很高的家族间临床变异性。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。mtDNAmtDNA的复制分离的复制分离的复制分离的复制分离 mtDNA mtDNA自主复制,不依赖核染自主复制,不依赖核染色体而将复制后的色体而将复制后的DNADNA分配到子细胞中去(这个过分配到子细胞中去(这个过程称为复制分离)。程称为复制分离)。在一个个体中,突变mtDNAmtDNA的比例随着复制分离而发生改变,的比例随着复制分离而发生改变,的比例随着复制分离而发生改变,的比例随着复制分离而发生改变,随着时间积累导致表现型的改变。随着时间积累导致表现型的改变。随着时间积累导致表现型的改变。随着时间积累导致表现型的改变。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 半自主性的细胞器半自主性的细胞器 线粒体基因组能够单独进行复制、转录及合成蛋白质,但这并不意味着线粒体基因组的遗传完全不受核基因的控制。线粒体自身结构和生命活动都需要核基因的参与并受其控制,说明真核细胞内尽管存在两个遗传系统,一个在细胞核内,一个在细胞质内,各自合成一些蛋白质和基因产物,造成了细胞核和细胞质对遗传的相互作用。 线粒体遗传系统仍需依赖于细胞核遗传系统线粒体遗传系统仍需依赖于细胞核遗传系统真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。细细胞胞分分裂裂时时,突突变变型型和和野野生生型型mtDNAmtDNA发发生生分分离离,随随机机地地分分配配到到子子细细胞胞中中,使使子子细细胞拥有不同比例的突变型胞拥有不同比例的突变型mtDNAmtDNA分子。分子。 在连续的分裂过程中,异质性细胞中突变在连续的分裂过程中,异质性细胞中突变型型mtDNA和野生型和野生型mtDNA的比例会发生漂的比例会发生漂变,向同质性的方向发展。变,向同质性的方向发展。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 表型的高度多态(polymorphism) mtDNA突变所产生的表型极为多态。在一个家系中,患病个体的表现可以完全不同;有的以血管病变为主,如中风、冠心病等;有的表现为不同程度的肌无力;有的以精神症状为主;有的以眼科疾病为突出表现。发病的年龄差异也很大。 真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 突变率比较高突变率比较高 主要分布主要分布 控制区(控制区(D-D-环区)环区)- - 含有启动子和重链复制的起点含有启动子和重链复制的起点 跨距约跨距约1100bp1100bp,个体间存在较大差异,个体间存在较大差异 高高 变变 区区 HV-I 29 HV-I 29 408 408号碱基号碱基 HV-II 15996 HV-II 15996 16401 16401号碱基号碱基 HV-III 438 HV-III 438 574 574号碱基号碱基 主要原因主要原因 A : mtDNA A : mtDNA没有组蛋白的保护没有组蛋白的保护 B : DNA B : DNA聚合酶缺乏聚合酶缺乏3-53-5外切酶校正功能外切酶校正功能 C : C : 缺乏缺乏DNADNA损伤的修复体系损伤的修复体系 D : mtDNA D : mtDNA极少或不受来自选择压力的影响极少或不受来自选择压力的影响 突变类型突变类型 碱基的错配碱基的错配-序列多态性序列多态性 主要为转换(主要为转换(90%90%):嘧啶转换):嘧啶转换 HV-I 80% HV-I 80% HV-II 20% HV-II 20% 少数是少数是顛顛换(换(10%10%):): CA CA 或或 AC AC 插入或缺失插入或缺失-长度多态性长度多态性 polyC polyC:nt16184-nt16193 ( HV-I )nt16184-nt16193 ( HV-I ) CA CA 重复:重复:nt514-nt523 ( HV-III ) nt514-nt523 ( HV-III ) 真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。mtDNA多态性的类型的类型1.点的多态性表现为表现为DNA链中发生单个碱基的突变,且突变导致一个原有链中发生单个碱基的突变,且突变导致一个原有酶切位点的丢失或形成一个新的酶切位点。酶切位点的丢失或形成一个新的酶切位点。Southern杂交杂交即可诊断。即可诊断。2.序列多态性由于由于DNA顺序上发生突变如缺失、重复、插入所致。顺序上发生突变如缺失、重复、插入所致。由于高变区(由于高变区(highlyvariableregion)内串联重复顺序)内串联重复顺序的拷贝数不同所产生的,其突出特征是限制性内切酶识别的拷贝数不同所产生的,其突出特征是限制性内切酶识别位点本身的碱基没有发生改变,改变的只是它在基因组中位点本身的碱基没有发生改变,改变的只是它在基因组中的相对位置。的相对位置。 真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。mtDNA多态性的应用:1.线粒体DNA与遗传性疾病的研究。2. 生物进化学者分析人类线粒体DNA与其他物种的对比,旨在确定它们的亲缘关系。3. 在法医学上用于个体识别。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。mtDNA单核苷酸多态性单核苷酸多态性概念:一个种族不同个体的基因组或共同序列之间,存在单个核苷酸的差异,这种差异就叫mtDNASNPmtDNASNP在人群中,在人群中,SNPSNP总有最小的等位基因频率,在单核苷酸多态总有最小的等位基因频率,在单核苷酸多态性一般有两个等位基因,最小等位基因频率实际就是较小性一般有两个等位基因,最小等位基因频率实际就是较小的等位基因频率。在不同的民族、地区中,同一个等位基的等位基因频率。在不同的民族、地区中,同一个等位基因的频率有高有低。因的频率有高有低。线粒体线粒体DNADNA序列中有序列中有11221122个碱基是非编码序列,在编码区个碱基是非编码序列,在编码区5555个碱基不参与编码蛋白。个碱基不参与编码蛋白。19811981年年AndersonAnderson等人完成最初的剑桥序列,样本主要是欧等人完成最初的剑桥序列,样本主要是欧洲血统的个体(这些样本包括一部分洲血统的个体(这些样本包括一部分HeLaHeLa细胞和牛的序细胞和牛的序列参入在内)。再次分析序列更正了最初序列,确定了列参入在内)。再次分析序列更正了最初序列,确定了1111处错误。现在以修正序列为准。处错误。现在以修正序列为准。实际线粒体序列共有实际线粒体序列共有16569bp16569bp。为了保持历史数据,由一个。为了保持历史数据,由一个缺失占据一个位置。缺失占据一个位置。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。序列多态性(Sequence polymorphism) 主要集中在D-loop区(法医学价值所在)HV1:nt16024nt16365,342bp; HV2:nt 73nt 340,268bpHV3:nt 438nt 574,137bp长度多态性(Length polymorphism)nt514-nt523:CA重复 C-stretch: polyC在法医学上常用的位点真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。Controlregion (D-loop)1/16,569cyt bND5ND6ND4ND4LND3COIIIATP6ATP8COII12S rRNA16S rRNAND1ND2COIOH9-bp deletionOLFVL1IQMWANCYS1DKGRHS2L2EPTHV1HV216024163657334016024576“16,569” bp122tRNAs2rRNAs13genesHeavy (H) strandLight (L) strandCodingRegion真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。mtDNA-STR主要集中在D-loop区;核心序列一般在10bp以下,常见的是CA重复(nt514-nt523)和 polyC (nt568-nt573和nt303-nt309).CA重复:重复次数在10次以下。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。近期研究表示线粒体DNA中某些重复序列与疾病有关。如线粒体DNA拷贝数大大低于正常,可引起致死性婴儿呼吸障碍。 实际人类mtDNA的长度不总是16569bp,可能会有10bp左右的增加。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。mtDNA多态性分析技术长度多态性:AMP-FLP分析技术序列多态性PCR-RFLP法PCR-SSO杂交法PCRDNA自动测序 目前分析mtDNA多态性最常用,也是最准确的方法。 真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。mtDNA单倍型在分子进化的研究中,线粒体单倍型或单倍群是一组类似的单倍型,它们有一个共同的单核苷酸多态性祖先。单倍群由相似的单倍型组成,所以可以从单倍型来预测单倍群。而单核苷酸多态性分析被用来确认单倍型。单倍群以字母来标记,并且以数字和一些字母来补充。 与与Y染色体染色体DNA单倍群区别。单倍群区别。遗传漂变:源自世代遗传过程中随机抽样引发的随机波动。遗传漂变:源自世代遗传过程中随机抽样引发的随机波动。单倍型的比例来源:基因突变和遗传漂变。单倍型的比例来源:基因突变和遗传漂变。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。人类线粒体DNA单倍型类群人类线粒体DNA单倍型类群是遗传学上依据线粒体DNA差异而定义出来的单倍群。可以追溯母系遗传的人类遗传。人类线粒体DNA单倍型以字母来标记,根据种群的不同把线粒体DNA单倍型分类真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。mtDNA分型命名线粒体DNA序列分析完成后,编辑和审查序列未知样本Q与已知的对照序列K(或修订剑桥序列)比对,记录SNP位点位置,等位基因种类、最后确定分型。已知序列常用D-环区的HVR-、HVR-和AC重复序列。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。命名1:插入1个碱基,命名为插入位置.1插入碱基真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。测序方法分析mtDNA序列多态性过程1.样本样本mtDNA提取提取2.PCR扩增扩增HV1和和HV2区域区域3.正、反向引物对正、反向引物对HV1和和HV2区域进行序列区域进行序列4.对比正反向序列确定对比正反向序列确定mtDNA序列序列5.与与Anderson序列对比找出不同碱基序列对比找出不同碱基6.确定该样本确定该样本mtDNA 的单体型的单体型真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。样本样本mtDNA提取提取样本:主要是缺乏毛囊的毛干,暴露在空气样本:主要是缺乏毛囊的毛干,暴露在空气的陈旧的骨骼、牙齿;的陈旧的骨骼、牙齿;核核DNA检测失败的血痕或拭子,核检测失败的血痕或拭子,核DNA检测失败的组织。检测失败的组织。重点介绍毛干和骨骼重点介绍毛干和骨骼mtDNA提取提取.真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 清洗毛干溶解细胞保护DNA分子,防止酶切纯化DNA存储DNA提取毛干中的DNA的步骤真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。二氧化硅悬浮液的制备骨粉的制备除菌,防止外源性DNA的污染真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。原理:对骨骼进行清洗、消毒、磨为粉末,原理:对骨骼进行清洗、消毒、磨为粉末,然后对骨细胞进行裂解,采用吸附和超滤然后对骨细胞进行裂解,采用吸附和超滤作用对作用对DNA提取和纯化。提取和纯化。骨细胞脱钙除去杂物,纯化DNA从gui珠洗脱DNA真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。人类线粒体基因组DNA高变区的分析主要是分析和。步骤:、第一次扩增用L15926-H00580引物扩增 控制区片段(1.3kb).2、第二次扩增用L15997-H16401引物和L00029-H00408引物分别扩增HVR和HVR片段。3、测序模板扩增 双链DNA测序经过L链和H链分别从两个方向侧序,对比两链相应碱基的互补性,可以获得准确的序列。4、测序 通常序列分析用自动荧光检测完成。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。人类线粒体基因组STR位点分析主要是位于D环中nt514-523位点处得CA重复。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。人类线粒体全基因组DNA分析通常使用直接测序的方法,即先用26对引物经PCR扩增出需要的片段,再将扩增产物直接测序,经序列软件分析得出样本线粒体全碱基序列,并根据未知样本的mtDNA全序列和修正剑桥序列对比得出结果。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 GAAAAAGTCT TTAACTCCAC CATTAGCACC CAAAGCTAAG ATTCTAATTT AAACTATTCT CTTTTTCAGA AATTGAGGTG GTAATCGTGG GTTTCGATTC TAAGATTAAA TTTGATAAGA 15970 15980 15990 16000 16010 16020 CTGTTCTTTC ATGGGGAAGC AGATTTGGGT ACCACCCAAG TATTGACTCA CCCATCAACA GACAAGAAAG TACCCCTTCG TCTAAACCCA TGGTGGGTTC ATAACTGAGT GGGTAGTTGT 16030 16040 16050 16060 16070 16080 ACCGCTATGT ATTTCGTACA TTACTGCCAG CCACCATGAA TATTGTACGG TACCATAAAT TGGCGATACA TAAAGCATGT AATGACGGTC GGTGGTACTT ATAACATGCC ATGGTATTTA 16090 16100 16110 16120 16130 16140 ACTTGACCAC CTGTAGTACA TAAAAACCCA ATCCACATCA AAACCCCCTC CCCATGCTTA TGAACTGGTG GACATCATGT ATTTTTGGGT TAGGTGTAGT TTTGGGGGAG GGGTACGAAT 16150 16160 16170 16180 16190 16200 CAAGCAAGTA CAGCAATCAA CCCTCAACTA TCACACATCA ACTGCAACTC CAAAGCCACC GTTCGTTCAT GTCGTTAGTT GGGAGTTGAT AGTGTGTAGT TGACGTTGAG GTTTCGGTGG 16210 16220 16230 16240 16250 16260 CCTCACCCAC TAGGATACCA ACAAACCTAC CCACCCTTAA CAGTACATAG TACATAAAGC GGAGTGGGTG ATCCTATGGT TGTTTGGATG GGTGGGAATT GTCATGTATC ATGTATTTCG 16270 16280 16290 16300 16310 16320 CATTTACCGT ACATAGCACA TTACAGTCAA ATCCCTTCTC GTCCCCATGG ATGACCCCCC GTAAATGGCA TGTATCGTGT AATGTCAGTT TAGGGAAGAG CAGGGGTACC TACTGGGGGG 16330 16340 16350 16360 16370 16380 TCAGATAGGG GTCCCTTGAC CACCATCCTC CGTGAAATCA ATATCCCGCA CAAGAGTGCT AGTCTATCCC CAGGGAACTG GTGGTAGGAG GCACTTTAGT TATAGGGCGT GTTCTCACGA 16390 16400 16410 16420 16430 16440 FBIA1(L15997)HV1C-stretchHV1FBIB1(H16391)Hypervariable Region I16024-16365342bpexaminedRevisedCambridgeReferenceSequence (rCRS) formerly known as the “Anderson” sequenceHV1真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。GATCACAGGT CTATCACCCT ATTAACCACT CACGGGAGCT CTCCATGCAT TTGGTATTTT CTAGTGTCCA GATAGTGGGA TAATTGGTGA GTGCCCTCGA GAGGTACGTA AACCATAAAA 10 20 30 40 50 60 CGTCTGGGGG GTATGCACGC GATAGCATTG CGAGACGCTG GAGCCGGAGC ACCCTATGTC GCAGACCCCC CATACGTGCG CTATCGTAAC GCTCTGCGAC CTCGGCCTCG TGGGATACAG 70 80 90 100 110 120 GCAGTATCTG TCTTTGATTC CTGCCTCATC CTATTATTTA TCGCACCTAC GTTCAATATT CGTCATAGAC AGAAACTAAG GACGGAGTAG GATAATAAAT AGCGTGGATG CAAGTTATAA 130 140 150 160 170 180 ACAGGCGAAC ATACTTACTA AAGTGTGTTA ATTAATTAAT GCTTGTAGGA CATAATAATA TGTCCGCTTG TATGAATGAT TTCACACAAT TAATTAATTA CGAACATCCT GTATTATTAT 190 200 210 220 230 240 ACAATTGAAT GTCTGCACAG CCACTTTCCA CACAGACATC ATAACAAAAA ATTTCCACCA TGTTAACTTA CAGACGTGTC GGTGAAAGGT GTGTCTGTAG TATTGTTTTT TAAAGGTGGT 250 260 270 280 290 300 AACCCCCCCT CCCCCGCTTC TGGCCACAGC ACTTAAACAC ATCTCTGCCA AACCCCAAAA TTGGGGGGGA GGGGGCGAAG ACCGGTGTCG TGAATTTGTG TAGAGACGGT TTGGGGTTTT 310 320 330 340 350 360 ACAAAGAACC CTAACACCAG CCTAACCAGA TTTCAAATTT TATCTTTTGG CGGTATGCAC TGTTTCTTGG GATTGTGGTC GGATTGGTCT AAAGTTTAAA ATAGAAAACC GCCATACGTG 370 380 390 400 410 420 TTTTAACAGT CACCCCCCAA CTAACACATT ATTTTCCCCT CCCACTCCCA TACTACTAAT AAAATTGTCA GTGGGGGGTT GATTGTGTAA TAAAAGGGGA GGGTGAGGGT ATGATGATTA 430 440 450 460 470 480HV2C-stretchHV2FBID1(H408)FBIC1(L048)Hypervariable Region II73-340268bpexaminedRevisedCambridgeReferenceSequence (rCRS) formerly known as the “Anderson” sequenceHV2真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 TCTTTC ATGGGGAAGC AGATTTGGGT ACCACCCAAG TATTGACTCA CCCATCAACA ACCGCTATGT ATTTCGTACA AGAAAG TACCCCTTCG TCTAAACCCA TGGTGGGTTC ATAACTGAGT GGGTAGTTGT TGGCGATACA TAAAGCATGT 16030 16040 16050 16060 16070 16080 16090 16100 TTACTGCCAG CCACCATGAA TATTGTACGG TACCATAAAT ACTTGACCAC CTGTAGTACA TAAAAACCCA ATCCACATCA AATGACGGTC GGTGGTACTT ATAACATGCC ATGGTATTTA TGAACTGGTG GACATCATGT ATTTTTGGGT TAGGTGTAGT 16110 16120 16130 16140 16150 16160 16170 16180 AAACCCCCTC CCCATGCTTA CAAGCAAGTA CAGCAATCAA CCCTCAACTA TCACACATCA ACTGCAACTC CAAAGCCACC TTTGGGGGAG GGGTACGAAT GTTCGTTCAT GTCGTTAGTT GGGAGTTGAT AGTGTGTAGT TGACGTTGAG GTTTCGGTGG 16190 16200 16210 16220 16230 16240 16250 16260 CCTCACCCAC TAGGATACCA ACAAACCTAC CCACCCTTAA CAGTACATAG TACATAAAGC CATTTACCGT ACATAGCACA GGAGTGGGTG ATCCTATGGT TGTTTGGATG GGTGGGAATT GTCATGTATC ATGTATTTCG GTAAATGGCA TGTATCGTGT 16270 16280 16290 16300 16310 16320 16330 16340 TTACAGTCAA ATCCCTTCTC GTCCC AATGTCAGTT TAGGGAAGAG CAGGG 16350 16360 ATGCACGC GATAGCATTG CGAGACGCTG GAGCCGGAGC ACCCTATGTC GCAGTATCTG TCTTTGATTC TACGTGCG CTATCGTAAC GCTCTGCGAC CTCGGCCTCG TGGGATACAG CGTCATAGAC AGAAACTAAG 80 90 100 110 120 130 140 CTGCCTCATC CTATTATTTA TCGCACCTAC GTTCAATATT ACAGGCGAAC ATACTTACTA AAGTGTGTTA ATTAATTAAT GACGGAGTAG GATAATAAAT AGCGTGGATG CAAGTTATAA TGTCCGCTTG TATGAATGAT TTCACACAAT TAATTAATTA 150 160 170 180 190 200 210 220 GCTTGTAGGA CATAATAATA ACAATTGAAT GTCTGCACAG CCACTTTCCA CACAGACATC ATAACAAAAA ATTTCCACCACGAACATCCT GTATTATTAT TGTTAACTTA CAGACGTGTC GGTGAAAGGT GTGTCTGTAG TATTGTTTTT TAAAGGTGGT 230 240 250 260 270 280 290 300 AACCCCCCCT CCCCCGCTTC TGGCCACAGC ACTTAAACACTTGGGGGGGA GGGGGCGAAG ACCGGTGTCG TGAATTTGTG 310 320 330 340RevisedCambridgeReferenceSequence (rCRS) formerly known as the “Anderson” sequenceHV1:16024-16365(342bpexamined)HV2:73-340(268bpexamined)HV1HV2真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。ACCGCTATGT ATTTCGTACA TTACTGCCAG CCACCATGAA TATTGTACGG TACCATAAAT 160901610016110161201613016140rCRSACCGCTATGT ATCTCGTACA TTACTGCCAG CCACCATGAA TATTGTACAG TACCATAAAT QKACCGCTATGT ATCTCGTACA TTACTGCCAG CCACCATGAA TATTGTACAG TACCATAAAT mtDNAsequencesfromtestedsamplesarealignedwiththereferencerCRSsequence (e.g., positions 16071-16140)SampleQ16093C16129ASampleK16093C16129ADifferencesarereportedbythepositionandthenucleotidechange (compared to the rCRS)Differences from Reference Sequence1609316129真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。1群体资料的特征 (1)序列变异:对无关个体样本作HV-I HV-II区段序列测定的群体调查,与标准序列比对,可以检测出高变区中出现碱基变异的特定位置数目,以及观察随机个体之间的碱基差异平均数目。碱基变异主要是点突变,多位置碱基变异;HV-I 区域变异高于 HV-II变异区段真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 HV-I区的变异位置数和区的变异位置数和变异碱基数都大于变异碱基数都大于HV-II真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。(2)群体参数 由于mtDNA是核外基因组,自主复制, 没有重组和交换,全部控制区的碱基序列的变异只能够看作是一个单倍型。 群体遗传变异率(度)群体遗传变异率(度)/基因多样性基因多样性(geneticdiversity)GD=(1-x2)n/(n-1)偶合率偶合率(matchprobability)个体识别力个体识别力(powerofdiscrimination)真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。群体遗传变异率(度)(群体遗传变异率(度)(geneticdiversity)h=(1-x2)n/(n-1)偶合率偶合率(matchprobability)p=x2mtDNA频率估计的计算如果在包括N个mtDNA分型的数据库内,观察到一定次数(X)的某一mtDNA分型,其频率计算公式P =X/ N可信区间上限概率P1.96 P(1-P)/N如果在数据库内未观察到分型,可信区间的上限1-a1/N A代表可信系数(0.0595%的可信区间)单体型单体型(haplotype) 真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 法医学实践中如何法医学实践中如何根据根据mtDNA序列多序列多态性进行个体识别或态性进行个体识别或亲子鉴定亲子鉴定?真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。mtDNA分型时注意事项数据解释Data Interpretation异质性异质性(Heteroplasmy)混合样品混合样品 ( (目前基本上不可能目前基本上不可能) )DNA 数据库大小Similar issues to Y-STRs but takes longer to generate mtDNA data than Y-STR haplotypesDNA Database Quality真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。Disadvantages to SequencingExpensiveError possibilities with more data to reviewMost information is not usedReview forward and reverse sequences across 610 bases only to report263G,315.1CMostcommontype:foundin7%ofCaucasians真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。(三)在法医学上的应用优点优点局限性局限性结果解释结果解释真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。mtDNAmtDNA的特点及其法医学应用优势的特点及其法医学应用优势1.唯一的核外DNA来源:可检测样品范围增大,为很少或没有nDNA(nucleic DNA)的样本的检验提供了希望,如骨骼、指甲、毛干等;2.拷贝数多:适于微量、高度降解样本;3.母系遗传:可选择的比对参照样本范围扩大。如遗骸的个人认定或一个失踪的人无法提供参考样本,可用其母亲、兄弟姐妹等血液作为参考样本。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。mtDNA序列分析的一般用于下列情况脱落毛发指甲、骨骼或牙齿样本极微量血痕核DNA分型失败样本真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。案例1 Holland等(1993年)对1984年越南归还的越战身亡美国士兵的残骸成功地进行了身源鉴定。这些残骸遗存于自然环境下长达24年之久。案例2 沙皇遗骸的辨认(1918年埋葬,1991年挖掘,1994年测定mtDNA序列)案例3 (1996年美国)现场仅从死者身上发现1根毛发。mtDNA序列分析与犯罪嫌疑人 Paul Ware 的完全匹配,Paul Ware 被判强奸、谋杀罪。这是mtDNA序列分析首次在法庭上作为证据。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。沙皇遗骸的辨认1917年,十月革命后,尼古拉二世被流放到西伯利亚的叶卡捷琳堡。1918年7月17 日清晨全家被枪杀(至少9人)。80年代后,俄罗斯总统叶利钦亲自参加了在圣彼得堡举行的安葬仪式。 真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。Identifying the Romanov Remains(the Last Russian Czar)TsarinaAlexandraTsarNicholasIIXeniaCheremeteff-SfiriPrincePhilipDukeofEdinburghGeorgijRomanovMitotype16111T16357C263G315.1CMitotype16126C16169T16294T16296T73G263G315.1C16169T/C16169T/CLouiseofHesse-CasselSOURCES: Gill et al. (1994) Nature Genetics, 6, 130135.; Ivanov et al. (1996) Nature Genetics, 12, 417420; Stone, R. (2004) Science, 303, 753.真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 Mitotyping在法医学应用的局限性(一)分型技术要求高,耗时耗力耗钱 FBI: 2003年计划$4,000,000再次资助4个区域性的法医mtDNA实验室; 一年约须2/3的人力分析大约120 mtDNA 的案件。(FBI laboratory 2002 annual report)真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。局局 限限 性(二)性(二)识别力相对较低:US Caucasians的 mtDNA database: 1175 个个体检出982种单倍型,7的US Caucasians 有common HV1/ HV 2型;13种其它的HV1/ HV2在人群中的比例为0.5。中国的mtDNA database:检出356种单倍型。非洲裔美洲人的mtDNA database:检出1655种单倍型(最多)。巴勒斯坦的mtDNA database:检出8种单倍型(最少)。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。局 限 性(三)不存在严格的匹配概念,不能作为绝对个人认定的遗传标记异质性高污染风险混合斑(几乎不可能)注意!注意!真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。异质性(Heteroplasmy)概念 :一个个体的线粒体DNA有两套或两套以上不同碱基序列差异的情况。 三种形式: a: 个体的不同组织中含有一种以上的mtDNA序列 B:同一个体同一组织的不同细胞的mtDNA序列不同 C:同一个体同一组织的不同细胞同一细胞间不同拷贝的线粒体间有不同序列。 在同一细胞中只有一个拷贝核染色体,但约有100000个拷贝的线粒体DNA,所以一个细胞内的mtDNA比例大于一定值时,才能被检测到其遗传突变(异质性)。异质性出现频率:2-8 % 为避免可能存在异质性影响序列必须双向测序和为避免可能存在异质性影响序列必须双向测序和至少重复一次。至少重复一次。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。异质性的种类异质性的种类:长度异质性:出现在HVnt16184-16193和HVnt1303-310,的多聚C区;序列异质性:在一个碱基的位置上出现两个碱基的存在,表现为基因重叠。注意:在mtDNA序列同时出现两个位点的异质性很少见。异质性样本的主要问题是不同组织间的碱基比例不同异质性样本的主要问题是不同组织间的碱基比例不同,如在毛发与毛发之间,和血液和毛发之间碱基的比例不同。一般实验室建议对同一个体的多根毛发检测序列异质性。注意事项注意事项异质性随着人的年龄增加而增加;在不同组织中的异质性不同,如在肌肉组织中最高。真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。长度异质性真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。16093(C/T)1608616101序列异质性16093真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。 在在mtDNA的的双双向向测测序序结结果果中中,在在同同一一碱碱基基的的位位置置出出现现了了明明显显高高于于背背景景水水平平的的两两个个峰峰(次次峰峰信信号号占占主峰的主峰的40%以上以上),则可考虑该位点的异质性。),则可考虑该位点的异质性。 国际法庭遗传学会标准国际法庭遗传学会标准(international society for forensic genetic, ISFG) 真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。结果解释结果解释比对样品有2个以上的碱基序列不同-排除比对样品有1个碱基序列不同 - 异质性 -不能确定比对样品碱基序列相同-不能排除,匹配 -可能来自嫌疑人 -可能来自与嫌疑人同一母系的人 -可能来自与嫌疑人无母系关系的同一个体考虑案件限定范围,可有认定意义。 真空干燥,又名解析干燥,是一种将物料置于负压条件下,并适当通过加热达到负压状态下的沸点或着通过降温使得物料凝固后通过溶点来干燥物料的干燥方式。
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