新的集成分类、降维策略与生物信息应用邹 权电子科技大学2020 年9月zouquannclab.nethttp:/lab.malab.cn/zq/集成学习集成学习的思想集成学习的思想“三个臭皮匠顶一个诸葛亮三个臭皮匠顶一个诸葛亮”会议制度的来源会议制度的来源集成学习的麻烦集成学习的麻烦三个臭皮匠真的顶一个诸葛亮么？三个臭皮匠真的顶一个诸葛亮么？如何证明集成后的结果优于之前的结果？如何证明集成后的结果优于之前的结果？zouquannclab.nethttp:/lab.malab.cn/zq/内容提纲处理不平衡数据的集成分类方法2基于PageRank的集成降维方法3 1生物信息学应用3zouquannclab.nethttp:/lab.malab.cn/zq/降维0.50.81.60.40.90.21.20.81.10.20.11.10.90.21.00.30.21.10.30.90.90.40.21.00.411100样本样本1样本样本2样本样本3对照对照1对照对照2不同的基因表达情况不同的基因表达情况zouquannclab.nethttp:/lab.malab.cn/zq/集成排序 http:/lab.malab.cn:5001/MRMD2.0/Homezouquannclab.nethttp:/lab.malab.cn/zq/PageRank创始人：拉里佩奇创始人：拉里佩奇(Larry Page ) Google创始人之一创始人之一uGoogle的创始人之一的创始人之一Larry Page于于1998年提出了年提出了PageRank，并应用在并应用在Google搜索引擎的检索结果排序上，该技术也是搜索引擎的检索结果排序上，该技术也是Google早期的核心技术之一早期的核心技术之一uLarry Page是是Google的创始的创始首席执行官首席执行官，2001年年4月转任现月转任现职产品总裁。他目前仍与职产品总裁。他目前仍与Eric Schmidt和和Sergey Brin一起共一起共同负责同负责 Google的日常运作。他在斯坦福大学攻读计算机科的日常运作。他在斯坦福大学攻读计算机科学博士学位期间，遇到了学博士学位期间，遇到了Sergey Brin，他们于，他们于1998年合伙年合伙创立创立Google。zouquannclab.nethttp:/lab.malab.cn/zq/PageRankzouquannclab.nethttp:/lab.malab.cn/zq/PageRank一例求矩阵求矩阵A A特征值特征值1 1对应的特征向量对应的特征向量M Mzouquannclab.nethttp:/lab.malab.cn/zq/集成排序 http:/lab.malab.cn:5001/MRMD2.0/Homezouquannclab.nethttp:/lab.malab.cn/zq/MRMDoMRMD1.0http:/lab.malab.cn/soft/MRMD/index.htmlJAVA版本，无需任何插件，速度快，适合大规模数据，没用版本，无需任何插件，速度快，适合大规模数据，没用ensembleoMRMD2.0http:/lab.malab.cn:5001/MRMD2.0/HomeAnaconda3(python3.6)，有插件，有插件，PageRank集成，有集成，有WebServeroMRMD3.0http:/lab.malab.cn/soft/MRMD3.0/index.html集合了集合了PageRank,LeaderRank,Hits和和TrustRank算法算法zouquannclab.nethttp:/lab.malab.cn/zq/集成分类Ensemble learning: Make weak classifiers to strong oneClassificationResultCombine to form theFinal strong classifierh1( ) h2()h3( ) h4( ) h5( ) h6() h7()zouquannclab.nethttp:/lab.malab.cn/zq/集成学习样本不平衡Ensemble learning for Class Imbalance Problem2024/9/23zouquannclab.nethttp:/lab.malab.cn/zq/应用1：转移瘤WeiTang,ShixiangWan,ZhenYang,AndrewE.Teschendorff*,Quan Zou*.TumorOriginDetectionwithTissue-SpecificmiRNAandDNAmethylationMarkers.Bioinformatics.2018,34(3):398-406.(SCI,IF2017=5.481,PMID:29028927)zouquannclab.nethttp:/lab.malab.cn/zq/Basicpolarandhydrophobicpropertiesarethemaincharactersthataffectthebindingoftranscriptionfactorstomethylationsites应用2:预测与甲基化DNA结合的TFZijieShen,QuanZou*.Basicpolarandhydrophobicpropertiesarethemaincharacteristicsthataffectthebindingoftranscriptionfactorstomethylationsites.Bioinformatics.Doi:10.1093/bioinformatics/btaa492感谢聆听！欢迎合作！zouquannclab.net电子科技大学电子科技大学 邹权邹权